原文来源：Yang K, Wen X, Sablok G. Method for the Large-Scale ...[作者空间]
教程地址下载snpEff地址解压unzip snpEff_latest_core.zip我的路径是/home/ch...[作者空间]
教程地址 annovar是一个对科研人员免费的工具，需要用edu邮箱才能下载安装。edu邮箱获取获取之后，点击此处...[作者空间]
最重要的参考链接 https://pmbio.org/course/#module-06-rnaseq githu...[作者空间]
The Power of RNA-seq Wageningen, June 11-13 2018 Program ...[作者空间]
在将原始数据和参考基因组数据处理好以后，就开始开始比对分析了比对所用到的参考基因组的索引文件和基因组注释文件都存放...[作者空间]
tophat2+cufflinks转录组测序实例将为你介绍转录组测序也就是最近热门的RNAseq整个流程，有兴趣的...[作者空间]
DESeq2是一个用于分析基因表达差异的R包，具体操作姚在R语言中运行1.R语言安装DESeq2 2.载入基因表达...[作者空间]
https://github.com/crazyhottommy/[作者空间]
刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文，练练手，为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Backg...[作者空间]
首先，一般我们分析水稻的数据时候，选用的是MSU和RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，这里只介绍MS...[作者空间]
作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做...[作者空间]
作业要求 这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走...[作者空间]
作业要求 1.实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个...[作者空间]
作业要求 在UCSC下载hg19参考基因组，群主博客有详细说明，从gencode数据库下载基因注释文件，并且用IG...[作者空间]
作业要求 需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试...[作者空间]
作业要求 比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2，并且搞懂它的用法。直接去h...[作者空间]
作业要求 本系列课程学习的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffo...[作者空间]
