-差异分析时,需考虑实验设计(样本组成)和测序原理向(测序深度、基因长度、RNA 组成)-转录组下游分析时,采用D...[作者空间]
写在前面参考1[https://cloud.tencent.com/developer/article/16251...[作者空间]
一、简介 1.NCBI-SRA 数据库 SRA: Sequence Read Archive: It belong...[作者空间]
一、可变剪切的意义和重要性 可变剪切(differential splicing)也叫做选择性剪切alternat...[作者空间]
在《Salmon 进行转录本定量》文章介绍了 Salmon 定量。定量后将数据导入 DESeq2 官网有简单的 t...[作者空间]
写在前面:新手老菜鸟,个人心得,不足之处欢迎交流指正;写作不易,转载前请联系我征得同意,谢谢。 1.基本原理 1....[作者空间]
featureCounts我们粉丝都耳熟能详了,我们转录组流程介绍的对比对后的bam文件基于基因注释文件定量的首选...[作者空间]
可变剪切定义 有些基因的一个mRNA前体通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一...[作者空间]
之前写过一篇文章Fastq-dump: 一个神奇的软件, 详细介绍了fastq-dump的用法。虽然fastq-d...[作者空间]
做生信的基本上都跟NCBI-SRA打过交道,尤其是fastq-dump大家肯定不陌生.NCBI的fastq-dum...[作者空间]