做GSEA分析你的基因到底该如何排序 大家都知道，GSEA最重要的就是数据集的所有背景基因按照某种指标排序好，这样...[作者空间]
1. 认识序列。 序列（sequence）： 就是字符串（string） s=abcdefghijklmnopqr...[作者空间]
持续更新ing.....最后更新时间：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux...[作者空间]
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时，都会涉及到 Background; 做分析时，分析工具会提供一些...[作者空间]
富集分析是了解一个基因集功能倾向性的一个方式，在组学研究领域应用广泛。常见的有基于差异基因的Over-repres...[作者空间]
动态规划是一种分阶段求解决策问题的数学思想，即“大事化小，小事化了”。 比如走楼梯问题，一个楼梯有10级，每次只能...[作者空间]
大家新年好呀~之前的一篇笔记我们关注了一下GSEA的原理：GSEA入门---------原理，今天我们将跟随文献上...[作者空间]
最近听了一个生信的live收获很大，其中大神有讲到GSEA图的介绍，很受启发，觉得可以抽点时间我们来好好看一看...[作者空间]
该脚本适用于featureCounts数counts后的cpm和tpm计算 setwd("~/Desktop")#...[作者空间]
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序列比对sequence alignment 概念：通过在序列中搜索一系列单个性状或性状模式来比较2个（双序列比对...[作者空间]
上个BBQ介绍了基于动态规划算法的全局序列比对和局部序列比对，今天这篇笔记简单的介绍一下什么是BLAST和BLAT...[作者空间]
一： 前言 测序的数据下机之后，我们一般是需要进行回贴到参考基因组上进行后续分析的（序列比对这一步一般都比较耗时间...[作者空间]
一：前言 在生信的分析学习过程中，对结果的可视化是非常重要的，在很多生信文章常见的就是热图，PCA等图。但是在画图...[作者空间]
最近看文献的时候GSEA分析的出现频率太高了，我想我是不是也该学习一下。帖子看了不少，官方的user guide也...[作者空间]
继上周后，介绍完Heng Li大神的bioawk之后，继续在他的博客闲逛，读到一篇简单也很有趣的文章。下面我会总结...[作者空间]
数据下载 使用本实验室一个RNA-seq（GSE56087）和一个circRNA-seq（未发布）的数据作为dis...[作者空间]
sequence1="AGWGAHEA"sequence2 = "PAWHEAEAG"gap= -8Blosum50[作者空间]
刘小泽写于18.11.30一般我们得到原始数据、质控过滤后，要么进行比对，要么序列拼接。序列比对的话可以选择参考基...[作者空间]
github：https://github.com/scottzijiezhang/m6A-seq_analysi...[作者空间]
