关注公众号，桓峰基因 前言 癌症到底是如何起源发生的？长期以来科学家们在揭示癌症起源的研究上花费了大量的人力和时间...[作者空间]
点击关注公众号，桓峰基因 上期我们就肿瘤克隆进化的概念有了初步的认识，那肿瘤到底是怎么进化，或者或者肿瘤进化模式是...[作者空间]
我们利用Pyclone和CITUP得到了三个文件即cellfreq.txt和tree.txt 和sample_id...[作者空间]
上一期介绍了Cardelino的使用，这期介绍RobustClone，我们知道单细胞数据的SNV和CNV检出率都是...[作者空间]
单细胞克隆进化也是目前的热点系列，接下来我们将介绍几款分析单细胞克隆进化的软件。前一期介绍的Canopy通过SNV...[作者空间]
前五期的肿瘤可进化分析都是基于组织或血液检出的SNV和CNV，而这几年兴起的单细胞，越来越展露头角，自然，单细胞克...[作者空间]
这期介绍CITUP 全称 Conality Inference in Tumors Using Phylogen...[作者空间]
第二个pipeline主要包括Pyclone+ citup+ Timespace，没有先介绍这个主要是因为Time...[作者空间]
上面两篇肿瘤克隆进化之后第三篇就是大家非常感兴趣的鱼图也就是sankey图，之前有发过一遍，但是好多学者反应不是很...[作者空间]
上期利用sciClone已经全面的复现了文章的相关内容，下面开始介绍ClonEvol软件的使用及相关问题，包括文章...[作者空间]
最近研究了一下克隆进化的流行pipeline，主流的主要有两套如下： Pyclone+ citup+ Time...[作者空间]
