之前写过画桑基图和网络图的推文:https://www.jianshu.com/p/ff295d3444b4[ht...[作者空间]
estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分,进而评估肿瘤的纯度,其原理通过特征的肿瘤...[作者空间]
这次和大家分享下利用ggmaplot绘制差异基因筛选后的火山图,用到的基因集是ggpubr里面自带的数据集diff...[作者空间]
0.肿瘤纯度[http://222.70.95.243:6893/files/ESTIMATE%E5%88%86%...[作者空间]
大佬给我的一张图,目前还不知道来源,但是感觉很好用:[作者空间]
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featur...[作者空间]
双向富集分析图 1.需求 上下调基因分别富集分析,把结果放在一张图上: 2.示例数据和r包准备 模拟的是kegg的...[作者空间]
官网:http://bioinf.wehi.edu.au/featureCounts/。featureCounts...[作者空间]
首先创建一个项目目录wes和存放每个步骤生成文件的子目录raw, clean, align, genome, hg...[作者空间]
简介 GFF和GTF是两种最常用的基因组注释格式,在信息分析中建库时除了需要fasta文件一般还会需要这两种文件,...[作者空间]
参考这些???我觉得学RNA-seq必看的文献!!???这篇写的特别好:RNAseq-workflowRNA-se...[作者空间]
安装 docker镜像安装 镜像使用方法 普通安装 在Mac OS X上使用Homebrew或者在Linux系统上...[作者空间]
Hisat2是现在很流行的主流比对软件,在现实生活中的mRNA-seq中,有很多时候我们需要将拿到的转录组与参考基...[作者空间]