美文网首页
生信随笔-写于20211225

生信随笔-写于20211225

作者: 小白兔和小毛驴 | 来源:发表于2021-12-24 17:22 被阅读0次

1.确定好研究方向后,开始下载数据之后,观察下载的数据大体分布,特别样本量不是很大的时候,记得去除异常值。

2.微RNA (miRNA) 是一种靶向多种mRNA 并通过触发翻译抑制和/或 RNA 降解来调节基因表达的非编码小RNA 分子。也就是miRNA的靶基因是mRNA,mRNA是唯一的编码RNA,miRNA,LncRNA是非编码RNA。例如miRNA——调控DNA转录——结合mRNA导致基因沉默——导致靶基因下调。

3.所有数据库提供的都是RNA(基因)表达谱,可以通过R中的Tinyarray包找到对应的LncRNA,详情见 https://gitee.com/swcyo/tinyarray

如何预测和鉴定miRNA的靶基因?

详情见: https://zhuanlan.zhihu.com/p/110357532

研究思路

1.基因两两配对后建模型除了贪婪算法组合出最佳组合外,也可以通过Lasso算法,建出一个有系数的基因对模型,这样可以画出3年或者5年的ROC曲线,临床疗效评估,3年不复发:临床认为基本治愈;5年不复发,:临床上认为完全治愈。这也是算AUC的意义所在。

KM曲线cutoff值怎么确定

https://www.jianshu.com/p/11d2cf8d1e28

相关文章

  • #每天一本书+一页笔记# 1379《极简快速阅读》

    #一生一万本计划# 10000/1379 【阅读日期】20211225 【书名】极简快速阅读 【作者】金正 【关键...

  • 头条号、简书、百家号、微信公众号之区别

    头条号、简书、百家号、微信公众号之区别 从2020年疫情期间开始写随笔以来,为了自己的兴趣爱好,将自己的随笔发布于...

  • 随笔(写于立秋)

    夏于时间上死亡 秋来时即为过往 少年郎,一叹白发苍苍 逆旅,行也匆忙 趁梦未来,踏清风远上 凭旧时点点,列星辰耀光...

  • 随笔,写于随州

    酝酿已久的《基金的性价比指数》一直没有完成,这周主要在忙基金小白营的课程、服务优化工作,目标只有一个:如何把财商、...

  • 随笔写于厕

    刚刚查了上两篇,没篇都是600多字,中间相隔16分钟,我突然地意识到我16分写了600字,这对一个曾经可以十分钟码...

  • 近些年的随笔

    写在前面,这是近些年来的一些随笔,有的写于高中课堂,有的写于大学课堂,有的写于旅行途中,有的写于学校操场,有的写于...

  • 20211225

    兰老师日记: 今天感恩节,问小朋友们童生中最想感谢谁,无一例外,全部感谢妈妈感谢爸爸。我故意引诱一下他们,也可以...

  • 20211225

    忘记发日记了……昨天晚上第一次喝酒把自己喝醉蒙圈了! 有可能是昨天早上才吃了一份海南粉,中午没有吃饭,到了晚上就直...

  • 20211225

    今日份手绘 这张画了好久,以后还是尽量不用平板画尺寸偏大的画了,有点费时间,可以着重画色稿图或者打草稿用,方便修改...

  • 午夜随笔 ——写于2018.1.29

    药喝了后,感冒也渐渐好了,晚上也不会像之前那么难受的咳嗽了。打算着早睡早起:洗了脸、洗了脚,躺床上看会儿...

网友评论

      本文标题:生信随笔-写于20211225

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/agidqrtx.html