小小程序tomato_tools使用说明
该程序可以快速输出需要查询的番茄4.0基因的CDS、蛋白序列和番茄与拟南芥的blast结果(e-value<1e-30).
使用操作主要三点:
- 安装python 3.XX版本
- 修改input.txt文件
- 点击脚本运行即可
首先python安装说明

点击压缩包里的最新版python。

勾选加入环境变量,其他的就正常安装就行。
修改输入文件

把这个文件里的基因号,改成自己需要查询的基因号即可,一行一个基因id。
运行程序
修改完输入文件,直接双击程序就可以了,然后会出现dos界面一直在闪,这个时候不要关闭,程序运行完会自动退出。

结果和输入文件展示
测试中,随机在三条染色体上选了一个基因,进行测试。
运行后,结果文件在Seq_res.txt中,具体信息如下:

会依次出现基因的CDS、蛋白和比对结果。注意的是,每次查询结果文件都会被覆盖,注意及时另存之前的结果。
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