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实验室自用小小小程序说明书——tomato_tools

实验室自用小小小程序说明书——tomato_tools

作者: 只看不写_nathan | 来源:发表于2020-10-17 11:31 被阅读0次

小小程序tomato_tools使用说明

该程序可以快速输出需要查询的番茄4.0基因的CDS、蛋白序列和番茄与拟南芥的blast结果(e-value<1e-30).
使用操作主要三点:

  • 安装python 3.XX版本
  • 修改input.txt文件
  • 点击脚本运行即可

首先python安装说明


点击压缩包里的最新版python。



勾选加入环境变量,其他的就正常安装就行。

修改输入文件

把这个文件里的基因号,改成自己需要查询的基因号即可,一行一个基因id。

运行程序

修改完输入文件,直接双击程序就可以了,然后会出现dos界面一直在闪,这个时候不要关闭,程序运行完会自动退出。


点两下就够了

结果和输入文件展示

测试中,随机在三条染色体上选了一个基因,进行测试。

运行后,结果文件在Seq_res.txt中,具体信息如下:



会依次出现基因的CDS、蛋白和比对结果。注意的是,每次查询结果文件都会被覆盖,注意及时另存之前的结果。

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