【生信知识】---Blast2.10+的安装及NT核酸数据库本地

前言：Blast最新版是2.10.0，同时因为项目需要，要做NT数据库，也就是核酸数据库的本地化。（NT是核酸库，NR是蛋白质库）

1. Blast下载及安装
   我选择用axel下载软件的源码，不知道axel的可以翻我之前的文章，解压即可使用blast

axel https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz
tar -xf ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz
cd ncbi-blast-2.10.0+/bin
./blastn -help

建议添加至环境变量

2. 下载NT核酸数据库
   NT数据库中，有被format好的NT数据库，共分割为25个子文件，把他们下载下来，解压就可以直接用，约65G：

   
   NT核酸库
   

   同样使用axel进行下载，因为axel在链接断掉后，可以自动重连：

mkdir NCBI_DB
for i in `seq 0 9`
do
axel https://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.0${i}.tar.gz
done

for i in `seq 10 24`
do
axel https://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nt.${i}.tar.gz
done

下载好的文件：

解压：

tar -xf *.tar.gz

解压完成后把全部的文件放到/home/xxx/blast/db，还需要在家目录下配置.ncbirc文件，在文件中添加内容：

[BLAST]
BLASTDB=/home/xxx/blast/db

3. 本地化Blast的使用

blastn -query test.fasta -db /path/to/NCBI_DB/nt -outfmt 6