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补坑-差异基因筛选

补坑-差异基因筛选

作者: 小森的生统笔记 | 来源:发表于2021-02-07 14:47 被阅读0次

师兄交给我一些基因表达量和p值和FDR,我硬着头皮跑别人的代码运气好的时候也能跑通,但是对于基础的一些知识还是不够理解,于是又来补坑啦。

  1. FoldChange
    FoldChange,就是两样品中同一个基因表达水平的变化倍数。可以用RPKM、FPKM或TPM值来计算。
  2. FDR
    FDR是校正后的p值,即q值
    参考转录组分析之差异基因筛选:FoldChange+FDR控制

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