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yarn使用cgroup隔离cpu资源

yarn使用cgroup隔离cpu资源

作者: 哪天改改 | 来源:发表于2017-03-19 22:35 被阅读0次

    yarn默认只管理内存资源,虽然也可以申请cpu资源,但是在没有cpu资源隔离的情况下效果并不是太好.在集群规模大,任务多时资源竞争的问题尤为严重.
    还好yarn提供的LinuxContainerExecutor可以通过cgroup来隔离cpu资源

    cgroup

    cgroup是系统提供的资源隔离功能,可以隔离系统的多种类型的资源,yarn只用来隔离cpu资源

    安装cgroup

    默认系统已经安装了cgroup了,如果没有安装可以通过命令安装
    CentOS 6

    yum install -y libcgroup
    

    CentOS 7

    yum install -y libcgroup-tools
    

    然后通过命令启动
    CentOS 6

    /etc/init.d/cgconfig start
    

    CentOS 7

    systemctl start cgconfig.service
    

    查看/cgroup目录,可以看到里面已经创建了一些目录,这些目录就是可以隔离的资源

    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 blkio
    drwxr-xr-x 3 root root 0 3月  19 20:56 cpu
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 cpuacct
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 cpuset
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 devices
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 freezer
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 memory
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月  19 20:56 net_cls
    

    如果目录没有创建可以执行

    cd /
    mkdir cgroup
    mount -t tmpfs cgroup_root ./cgroup
    mkdir cgroup/cpuset
    mount -t cgroup -ocpuset cpuset ./cgroup/cpuset/
    mkdir cgroup/cpu
    mount -t cgroup -ocpu cpu ./cgroup/cpu/
    mkdir cgroup/memory
    mount -t cgroup -omemory memory ./cgroup/memory/
    

    通过cgroup隔离cpu资源的步骤为

    1. 在cpu目录创建分组
      cgroup以组为单位隔离资源,同一个组可以使用的资源相同
      一个组在cgroup里面体现为一个文件夹,创建分组直接使用mkdir命令即可.
      组下面还可以创建下级组.最终可以形成一个树形结构来完成复杂的资源隔离方案.
      每当创建了一个组,系统会自动在目录立即创建一些文件,资源控制主要就是通过配置这些文件来完成
    --w--w--w- 1 root root 0 3月  19 21:09 cgroup.event_control
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cgroup.procs
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cpu.cfs_period_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cpu.cfs_quota_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cpu.rt_period_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cpu.rt_runtime_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cpu.shares
    -r--r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 cpu.stat
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 notify_on_release
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月  19 21:09 tasks
    

    yarn默认使用hadoop-yarn组作为最上层,任务运行时yarn会为每个container在hadoop-yarn里面创建一个组
    yarn主要使用cpu.cfs_quota_us cpu.cfs_period_us cpu.shares3个文件
    yarn使用cgroup的两种方式来控制cpu资源分配

    1. 严格按核数隔离资源
      可使用核数 = cpu.cfs_quota_us/cpu.cfs_period_us
      在yarn中cpu.cfs_quota_us被直接设置为1000000(这个参数可以设置的最大值)
      然后根据任务申请的core来计算出cpu.cfs_period_us
    2. 按比例隔离资源
      按每个分组里面cpu.shares的比率来分配cpu
      比如A B C三个分组,cpu.shares分别设置为1024 1024 2048,那么他们可以使用的cpu比率为1:1:2
    3. 将进程id添加到指定组的tasks文件
      创建完分组后只需要将要限制的进程的id写入tasks文件即可,如果需要解除限制,在tasks文件删除即可

    yarn配置

    启动cgroup需要配置几个配置文件

    etc/hadoop/yarn-site.xml配置

    可以参考http://hadoop.apache.org/docs/current/hadoop-yarn/hadoop-yarn-site/NodeManagerCgroups.html 配置
    这些配置大部分都是固定配置

    <property>
        <name>yarn.nodemanager.container-executor.class</name>
      <value>org.apache.hadoop.yarn.server.nodemanager.LinuxContainerExecutor</value>
    </property>
    <property>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.resources-handler.class</name>
        <value>org.apache.hadoop.yarn.server.nodemanager.util.CgroupsLCEResourcesHandler</value>
    </property>
    <property>
        <description>yarn使用的cgroup组,默认为/hadoop-yarn</description>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.cgroups.hierarchy</name>
        <value>/hadoop-yarn</value>
    </property>
    <property>
        <description>是否自动挂载cgroup</description>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.cgroups.mount</name>
        <value>true</value>
    </property>
    <property>
        <description>cgroup挂载目录, /sys/fs/cgroup 或者是 /cgroup,目录和系统有关</description>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.cgroups.mount-path</name>
        <value>/cgroup</value>
    </property>
    <property>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.group</name>
        <value>hadoop</value>
    </property>
    <property>
        <description>配置nodemanager使用多少物理cpu资源,比如24核服务器配置90的话,最近使用21.6核</description>
        <name>yarn.nodemanager.resource.percentage-physical-cpu-limit</name>
        <value>90</value>
    </property>
    <property>
        <description>是控制是否严格限制cpu,即按任务申请的core限制,还是非严格限制,即按core的比率限制</description>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.cgroups.strict-resource-usage</name>
        <value>true</value>
    </property>
    <property>
        <description>非安全模式将会以这里设置的用户运行container,比如配置hadoop用户则以hadoop运行container</description>
        <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.nonsecure-mode.local-user</name>
        <value>hadoop</value>
    </property>
    

    etc/hadoop/container-executor.cfg配置

    这个配置文件每项都需要填,要不然会报错

    yarn.nodemanager.linux-container-executor.group=hadoop
    banned.users=root
    min.user.id=1000
    allowed.system.users=hadoop
    

    权限设置

    在配置中文件的权限有特殊要求

    chown root:hadoop bin/container-executor
    chmod 6050 bin/container-executor
    

    系统还要求etc/hadoop/container-executor.cfg 的所有父目录(一直到/ 目录) owner 都为 root
    这个路径是默认${HADOOP_HOME}/etc/hadoop/container-executor.cfg,如果不方便修改所有父级目录为root权限,可以重新编译代码到其他目录,比如/etc/hadoop/目录

    mvn clean package -Dcontainer-executor.conf.dir=/etc/hadoop/ -DskipTests -Pnative
    

    配置好以后检测是否配置成功

    ./bin/container-executor --checksetup
    

    如果没有任何输出表示配置成功
    如果一切顺利就可以启动集群了

    测试cgroup

    可以运行测试脚本测试系统

    ./bin/spark-submit   \
    --class org.apache.spark.examples.SparkPi   \
    --master yarn-cluster   \
    --deploy-mode cluster   \
    --num-executors 5 \
    --executor-cores 3 \
    --executor-memory 4G \
    --driver-memory 4G \
    --driver-cores 2 \
    lib/spark-examples-1.6.0-hadoop2.6.0.jar   10000```
    查看系统是否生效只能登录到服务器查看
    通过`top`查看信息
    ![](https://img.haomeiwen.com/i1439367/810b62ff2e95679d.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
    查看是否创建了cgroup分组,`ll /cgroup/hadoop-yarn/`
    

    --w--w--w- 1 root root 0 3月 17 15:44 cgroup.event_control
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 cgroup.procs
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000011
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000026
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000051
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000076
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000101
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000123
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000136
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:06 container_1489736876249_0003_01_000155
    drwxr-xr-x 2 root root 0 3月 17 16:30 container_1489736876249_0004_01_000008
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:47 cpu.cfs_period_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:47 cpu.cfs_quota_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 cpu.rt_period_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 cpu.rt_runtime_us
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 cpu.shares
    -r--r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 cpu.stat
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 notify_on_release
    -rw-r--r-- 1 root root 0 3月 17 15:44 tasks

    查看`container_*`目录下 `cpu.cfs_period_us`,计算` cpu.cfs_quota_us/cpu.cfs_period_us`即可知道分配的核数
    

    [root@- ~]# cat /cgroup/cpu/hadoop-yarn/container*/cpu.cfs_period_us
    462962
    462962
    462962
    462962
    462962
    462962
    462962
    462962
    308641

    ## 问题处理
    配置的过程中免不了会碰上一些问题,以下是我碰到的问题
    ### spark任务申请了core,`node manager`分配不正确,都是分配1个核
    这个是由于目前使用的`capacity scheduler`的资源计算方式只考虑了内存,没有考虑CPU
    这种方式会导致资源使用情况统计不准确,比如一个saprk程序启动命令资源参数如下
    

    --num-executors 1 --executor-cores 3 --executor-memory 4G --driver-memory 4G --driver-cores 1

    DefaultResourceCalculator  统计占2核
    DominantResourceCalculator 统计占4核
    修改配置文件即可解决
    

    <property>
    <name>yarn.scheduler.capacity.resource-calculator</name>
    <value>org.apache.hadoop.yarn.util.resource.DominantResourceCalculator</value>
    <description>
    The ResourceCalculator implementation to be used to compare
    Resources in the scheduler.
    The default i.e. DefaultResourceCalculator only uses Memory while
    DominantResourceCalculator uses dominant-resource to compare
    multi-dimensional resources such as Memory, CPU etc.
    </description>
    </property>

    ### container-executor运行时报缺少GLIBC_2.14库
    

    container-executor: /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.14' not found (required by bin/container-executor)

    这个和系统版本有关,只能通过重新编译`container-executor`来解决
    

    mvn clean package -Dcontainer-executor.conf.dir=/etc/hadoop/ -DskipTests -Pnative

    ### centos 7系统container启动报错,不能写入/cgroup/cpu
    这个是yarn在centos 7下的一个bug,hadoop 2.8以后的版本才会解决
    这个bug主要是因为centos 7下cgroup的目录和centos 6不一致导致,centos 7 cpu目录合并成`cpu,cpuacct`, 这个`,`导致的错误,需要打补丁后编译 https://issues.apache.org/jira/browse/YARN-2194
    
    

    private String findControllerInMtab(String controller,
    Map<String, List<String>> entries) {
    for (Entry<String, List<String>> e : entries.entrySet()) {
    // if (e.getValue().contains(controller))
    // return e.getKey();

      if (e.getValue().contains(controller)) {
        String controllerKey = e.getKey();
        // In Redhat7, the controller is called "/sys/fs/cgroup/cpu,cpuacct"
        controllerKey = controllerKey.replace("cpu,cpuacct", "cpu");
        if (new File(controllerKey).exists()) {
          return controllerKey;
        }
      }
    }
    
    return null;
    

    }

    ## 升级的风险
    由于改变了资源的隔离方式,升级可能有几个方面的影响
    ### 任务资源分配问题
    升级cgroup后单个任务如果以前资源分配不合理可能会出现计算延时情况,出现资源问题时需要调整任务资源
    在集群规模小的时候可能没有资源可以调整,那么可以修改为非严格模式,非严格模式不能按配置限制资源,只能保证资源不被少数进程全部占用
    

    <property>
    <name>yarn.nodemanager.linux-container-executor.cgroups.strict-resource-usage</name>
    <value>false</value>
    </property

    ### spark driver资源问题
    spark任务的driver在集群模式`deploy-mode cluster `时,如果没有配置`driver-cores`的话默认分配1核,1核在任务规模大时有可能资源会紧张.采用`deploy-mode client `模式的不受cgroup限制

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