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ITK基础(一) — 二值化分割

ITK基础(一) — 二值化分割

作者: 小张Python | 来源:发表于2020-09-12 17:16 被阅读0次

    ITK 全称为 Insight Toolkit ,是一款开源、跨平台、用于图像分析工具包,开发遵循极限编程,主流使用语言为 C++,但目前开发团队已经提供了面向 Python 的接口。

    ITK 内部封装了许多优秀算法。ITK 可用于图像处理、配准、分割等领域,处理图像维度面向二维、三维或者更高维度

    原理讲解

    本文为 ITK 系列教程的第一篇文章,主要介绍该工具包中二值化分割功能的实现;图像分割的目的通过改变图像像素值,来提取我们想要的区域,一般是图像处理的大前提;

    ITK 中的二值化分割主要用到 itk::BinaryThresholdImageFilter 过滤器,其分割原理图如下:

    Snipaste_2020-05-03_15-50-50.png

    二值化分割是分割方法中最基础的,通过定义 Lower 和 Upper 两个像素临界点

    只要图像像素值在者之间,则该像素值将改编为 Insidevalue;否则将改为 Outsidevalue;最终图像的像素值只有两种:Insidevalue 或者是 Outsidevalue;

    注:上面的 Insidevalue、Outsidevalue、Lowervalue、Uppervalue 四个参数是用户自己设定的。

    代码实现

    上文已经提到了,二值化分割主要用到的头文件为 itkBinaryThresholdImageFilter ,该过滤器主要通过设置四个参数来完成分割效果。

    下面的代码部分就是关于二值分割的功能实现,代码中,依次进行图像读取、参数设定、二值化处理、图像写出等一系列步骤

    #include<itkBinaryThresholdImageFilter.h>
    #include<itkImage.h>
    #include<itkImageFileReader.h>
    #include<itkImageFileWriter.h>
    #include<itkPNGImageIOFactory.h>
    #include<string.h>
    ​
    using namespace std;
    ​
    int Binary_Threshold()
    {
    ​
     itk::PNGImageIOFactory::RegisterOneFactory();
    ​
     string input_name = "D:/ceshi1/ITK/Filter/Threshold_Seg/input.png";
     string output_name = "D:/ceshi1/ITK/Filter/Threshold_Seg/output.png";
    ​
    ​
     using InputPixelType = unsigned char;
     using OutputPixelType = unsigned char;
    
     using InputImageType = itk::Image<InputPixelType, 2>;
     using OutputImageType = itk::Image<OutputPixelType, 2>;
    
     using FilterType = itk::BinaryThresholdImageFilter<InputImageType, OutputImageType>;
    
     using ReaderType = itk::ImageFileReader<InputImageType>;
     using WriterType = itk::ImageFileWriter<OutputImageType>;
    
     ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
     WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
    
     FilterType::Pointer filter = FilterType::New();
    
     reader->SetFileName(input_name);
    ​
     filter->SetInput(reader->GetOutput());
     writer->SetInput(filter->GetOutput());
     writer->SetFileName(output_name);
    
     const OutputPixelType  outsidevalue = 0;
     const InputPixelType  insidevalue = 255;
    
     filter->SetOutsideValue(outsidevalue);
     filter->SetInsideValue(insidevalue);
    
     const InputPixelType lowerThreshold = 150;
     const OutputPixelType upperThreshold = 180;
    ​
    ​
     filter->SetUpperThreshold(upperThreshold);
     filter->SetLowerThreshold(lowerThreshold);
    
     try
     {
     filter->Update();// Running Filter;
     writer->Update();//Runing Writer;
    ​
     }
     catch(exception &e)
     {
     cout << "Caught Error!" << endl;
     cout << e.what() << endl;
    ​
     return EXIT_FAILURE;
     }
    ​
     return EXIT_SUCCESS;
    
    

    这里 Insidevalue 设置为 0 (黑色),Outsidevalue 设置为 255(白色);阈值分割区间设为 (150,180 );选取的分割图像为 ITK 官方提供的脑部切片 PNG 图片,最终的分割结果如下

    Snipaste_2020-05-03_16-29-53.png

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