美文网首页
2022-11-30 seurat如何复现文章数据

2022-11-30 seurat如何复现文章数据

作者: kke_wang | 来源:发表于2022-11-30 12:26 被阅读0次
  1. 从文章中下载的数据往往是一个表达矩阵和metadata.txt，如何使用这两个数据呢？
  • 读入表达矩阵，创建seurat对象
    nature<-readRDS("counts.Rds")
    nature <- CreateSeuratObject(counts = nature,min.cells = 3, min.features = 200)
  • 添加metadata
    meta<-read.table("meta.txt")
    nature=AddMetaData(nature,metadata = meta)
    如果要删除某一列metadata，则
    nature@metadata$cell_type = NULL

相关文章

网友评论

      本文标题：2022-11-30 seurat如何复现文章数据

      本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/biqjfdtx.html

      延伸阅读

      深度阅读

      • 您也可以注册成为美文阅读网的作者，发表您的原创作品、分享您的心情！

      栏目导航

      热点阅读

      关于我们|服务条款|联系我们|2022-11-30 seurat如何复现文章数据|投稿指南|网站地图|RSS订阅|排版工具|手机版

      提供经典美文摘抄,优美散文欣赏,现代诗歌精选,短篇小说,心情随笔,表白情书范文,故事会在线阅读欣赏

      Copyright © 2014-2023 Haomeiwen.com All Rights Reserved. 好美文阅读网 版权所有

      备案信息：桂公网安备 45052102000051号 · 桂ICP备13007215号-3

      本站所收录作品、热点评论等信息部分来源互联网，目的只是为了系统归纳学习和传递资讯

      所有作品版权归原创作者所有，与本站立场无关，如不慎侵犯了你的权益，请联系我们告知，我们将做删除处理！