参考:https://www.bilibili.com/video/BV1vE411c7LC/?spm_id_from=333.788.videocard.1
up主:誉川中医药
OMIM 数据库
通过OMIM主页搜索相关疾病。
https://omim.org/
完成后将相应内容下载到本地。
对内容进行排序和分列。需要内容为星号对应的MIM Number 对应title部分的分号后面的内容。
drugbank
也可以利用drugbank 对于疾病的检索搜索相关药物
虽然drugbank 也只是提供了蛋白target,但也可以用之前TCMSP数据库处理的方法,借助uniprot数据库,获取基因靶点信息。
genecard database
GENECARD 数据库 https://www.genecards.org/
类似的思路直接搜索疾病
gene card 就已经直接写好了单独的靶点缩写和一些描述,对于后期处理非常方便。
而且官网上对于不同的靶点也提供了相关的文章可以溯源。
另外可以通过评分的数值来筛选靶点。(excel 操作一下)比如说大于中位数之类。(留个坑,到底怎么样的评分具备差异以值得研究)
TTD 数据库
给了靶点和药物,以及相关验证的文献。
DisGeNET 数据库
提供总结与证据,甚至还有突变的相关信息。相当全面了。
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