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2021-09-14 qiime 2021.8 安装记录

2021-09-14 qiime 2021.8 安装记录

作者: 生信圈 | 来源:发表于2021-09-13 18:13 被阅读0次

1.环境:CentOS7+已安装好miniconda    

2.conda安装wget

<code>conda install wget</code>

3.下载conda环境文件

<pre>wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2021.8-py38-linux-conda.yml</pre>

4.修改yml文件,配置镜像地址,国内源

Channels 有4个,修改2-4,原:

<pre>- qiime2/label/r2021.8

- conda-forge

- bioconda

- defaults

</pre>

现:

<pre>
- qiime2/label/r2021.8

  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

  - defaults

</pre>

5.开始安装!

<pre>conda env create -n qiime2-2021.8 --file qiime2-2021.8-py38-linux-conda.yml</pre>

安装好了!

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