十三岁的魔女琪琪，在一个晴朗的满月之夜，带着黑猫吉吉至别的城市修行。魔女到了十三岁就必须自立，可是琪琪只稍微懂得骑扫帚的法术，让父母颇为担心。琪琪在街上愉快地飞着，却意外地造成交通事故，被警察拦了下来。一位名叫蜻蜓的男孩帮助她溜开，但琪琪却因无法忍受他那随便的态度而飞走了。 由于没有身分证，琪琪不能住旅馆，原本准备另觅一座城市，后来替面包店的老板娘欧思娜送奶嘴而受她的热情招待。怀着身孕的欧思娜太太很喜欢琪琪，在得知琪琪没有住处后，就让她住了下来。琪琪在此开始她的新生活。由于没什么专长，她只好开快递公司，其余时间便在店里帮忙。 甫进家门，就有第一位客人拜托送生日礼物，那礼物竟是与吉吉长得一样的猫玩偶，装在一个鸟笼中。然而中途被乌鸦攻击玩偶损伤了~因此拿吉吉代替先送去了。在森林寻找失落玩偶是认识了女画家琪琪应客人的要求来到一位夫人家，夫人想送鲱鱼南瓜派至孙女的舞会，但因电烤箱失灵而烤不好。夫人坚持付钱给琪琪，琪琪不好意思，看还有一点时间，便使用一旁的旧式烤箱，没想到送东西至舞会，孙女却一副嫌恶貌，并气冲冲地关上大门。隔天琪琪打电话回面包店，欧思娜说上次的夫人又找她了，她便在回程时去一趟。夫人送琪琪一个蛋糕，感谢上次她的帮忙，琪琪深受感动。当时电视正在转播飞行船起飞，却因一阵暴风出了意外，固定的绳索被吹掉，飞行船像个气球般飞了上去，绳索将蜻蜓和一辆警车一起拉上去。琪琪立刻去现场看情况。过了一会儿警车掉了下来，蜻蜓更显得岌岌可危。琪琪向旁边的老伯伯借了一把刷子，冲向飞行船。飞行船随风飘荡，撞到了钟塔。钟塔的老伯伯想帮蜻蜓的忙，可惜没有成功。眼见蜻蜓快要撑不住，琪琪在千钧一发之际救了蜻蜓，现场欢声雷动，在电视机旁琪琪的朋友们都高兴极了， 欧思娜却在此时要生产了！面对记者的采访，蜻蜓显得十分兴奋，琪琪仅偎着吉吉微笑。
片尾
蜻蜓试航人力飞机，琪琪在一旁骑着刷子，蜻蜓的朋友们在地上向他们招手。欧思娜生了小 baby ，莉莉也生了小猫咪。琪琪与大家成了好友，更妙的是在琪琪欣赏橱窗美丽的服饰时，却看到有小朋友模仿她的服装呢！琪琪写信回家，说她开始有信心了，很喜欢这个城市。
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