sequenceserver

部署网页版Sequenceserver

1. 更新apt包

apt update
apt-get update

2. 下载相应依赖

apt -y install gcc
apt install make
apt install ruby ruby-dev rubygems-integration
apt-get install ncbi-blast+
#yum安装也可

3. 给gem换源（接下来下载sequenceserver会更快些）

gem sources --add https://gems.ruby-china.com/ --remove https://rubygems.org/

4. 下载sequenceserver（需要时间等待）

gem install sequenceserver

5. 下载成功的标志

   
   sequenceserver下载成功后的标志
6. 找到sequenceserver的安装位置

whereis sequenceserver #下面一行是我的sequenceserver的安装位置
sequenceserver: /usr/local/bin/sequenceserver

7. 进入sequenceserver的安装目录并创建一个数据库文件夹将已有的.fa文件移动到这个数据库文件夹下（记住这个数据库文件夹的绝对路径下面要用）

cd /usr/local/bin/ #进入sequenceserver的安装目录
mkdir db #创建db文件夹

cd /usr/local/bin/ #进入sequenceserver的安装目录
mkdir db #创建db文件夹

图片.png

8. 运行sequenceserver

sequenceserver

9. 提示你需要输入数据库的路径（此处的路径为上文提到的路径）

   
   图片.png

10. 输入路径后（接下来根据提示默认或按Y就可以了）

    
    输入数据库路径

11. 成功，在浏览器上根据下文的提示浏览就可以了（本文在浏览器输入http://localhost:4567就可以了，如使用的docker不要忘记docker的端口映射，根据自己的端口访问）
    

    图片.png