部署网页版Sequenceserver
- 更新apt包
apt update
apt-get update
- 下载相应依赖
apt -y install gcc
apt install make
apt install ruby ruby-dev rubygems-integration
apt-get install ncbi-blast+
#yum安装也可
- 给gem换源（接下来下载sequenceserver会更快些）
gem sources --add https://gems.ruby-china.com/ --remove https://rubygems.org/
- 下载sequenceserver（需要时间等待）
gem install sequenceserver
-
下载成功的标志
sequenceserver下载成功后的标志
- 找到sequenceserver的安装位置
whereis sequenceserver #下面一行是我的sequenceserver的安装位置
sequenceserver: /usr/local/bin/sequenceserver
- 进入sequenceserver的安装目录并创建一个数据库文件夹将已有的.fa文件移动到这个数据库文件夹下（记住这个数据库文件夹的绝对路径下面要用）
cd /usr/local/bin/ #进入sequenceserver的安装目录
mkdir db #创建db文件夹
cd /usr/local/bin/ #进入sequenceserver的安装目录
mkdir db #创建db文件夹
图片.png
- 运行sequenceserver
sequenceserver
-
提示你需要输入数据库的路径（此处的路径为上文提到的路径）
图片.png
-
输入路径后（接下来根据提示默认或按Y就可以了）
输入数据库路径
-
成功，在浏览器上根据下文的提示浏览就可以了（本文在浏览器输入http://localhost:4567就可以了，如使用的docker不要忘记docker的端口映射，根据自己的端口访问）
图片.png
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