细胞鉴定方法

1. 基于R包对细胞类型鉴定,
   使用singleR包对细胞类型预测，singleR能够与seurat包完美结合，使用比较方便。
   优点：省时省力
   缺点：鉴定不准确
   使用SingleR包进行单细胞类型注释分析 ：https://www.jianshu.com/p/15937402b405

https://www.jianshu.com/p/ebf4d16ca572

2. 基于已有的数据库
   常见 marker gene 数据库有：CellMarker、Mouse Cell Atlas、cd_marker_handbook、PanglaoDB等。
   使用CellMarker网站http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/index.jsp查询某类型细胞标志基因，也可以查询基因所标志的细胞类型。统计各聚类marker gene在CellMarker网址细胞类型中出现的频次，在频次较高几个细胞类型中进一步确定。
   优点：速度相对较快
   缺点：鉴定结果不佳

3. 网上查找 相应的marker 信息
   生物公司网站，均有类似 生物抗体的页面，但是 这部分信息 一般是 marker蛋白的信息，需要将其转换成 对应的marker 基因。
   https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/

4. 查阅文献
   结合一些文献里面各预测类群的marker gene在目标类群里面的表达情况进行分类。
   优点：准确
   缺点：费时费力