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不同基因组版本切换

不同基因组版本切换

作者: 超级无敌大蜗牛 | 来源:发表于2022-10-19 17:15 被阅读0次

    👇 安装CrossMap

    pip install CrossMap
    
    CrossMap
    CrossMap 0.6.0 documentation

    👇 下载liftOver文件
    Index of /goldenPath/hg19/liftOver (ucsc.edu)

    wget -c http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/liftOver/hg19ToHg38.over.chain.gz
    gunzip hg19ToHg38.over.chain.gz
    

    👇 转换bw文件

    CrossMap.py bigwig ../reference/hg19ToHg38.over.chain GSM2359978_Control_0hr.bw output.bw
    

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