！
功能介绍 整理生信小知识库，一些技巧一些知识。
昨天
以下配置环境基于window操作系统，安装python3版本为例，推荐基础版配置。
METHOD 1 （基础版）
官网下载对应电脑版本的python3：https://www.python.org/downloads/windows/
下载程序文件完成后双击执行，注意：勾选Add Python 3.X to PATH。然后点击 Install Now，后续一直点击确认即可。（如果未勾选Add Python to PATH，安装完成后需要手动添加目录到环境变量中，参考后续步骤3.a）
确认完成
键盘win+R调出运行框，输入cmd，回车。（或依次点击开始-Windows 系统-命令提示符）。键入python后回车，出现如下提示即表示安装完成，键入exit()回车可退出
（optional）没有勾选自动添加python3到环境变量，可手动添加
找到python3安装目录，记不得当初安装的目录，可在C盘搜索关键词python3，本次安装的是3.8版本，选择正确的目录后，右键选择打开文件夹位置，选择地址栏并复制
右键我的电脑打开属性-高级系统设置-环境变量，选系统变量中Path一栏点击编辑
点击新建，将第i步复制的路径粘贴进去；再次点击新建，粘贴路径再手动添加\Script\，如下图。后续一直确认即可，同样可以用步骤三的方法确认是否成功。
安装模块。打开命令提示符，键入pip install 模块名，等待安装完成即可。
修改并运行脚本。
如果未安装其他编辑器，可选择python3安装自带的IDLE工具打开脚本进行编辑；运行脚本只需将脚本文件拷贝放置到正确目录，双击即可运行。（对于仅需要运行python脚本的用户，到此即可）
通过sublime文本编辑器修改并运行脚本
Sublime Text 是一个文本编辑器（收费软件，可以无限期试用，只是偶尔会有激活提示弹窗，关闭即可），下载链接：https://www.sublimetext.com/，下载后双击安装即可。
配置sublime的python3环境。打开软件，选择Tools-Build System-New Build System，写入如下内容，注意：修改图中红色框python的路径为步骤3.a.i所粘贴的路径，并将斜杠（/）改成双反斜杠（\\）
{ "encoding": "utf-8", "working_dir": "$file_path", "shell_cmd": "C:\\Users\\aiyac\\Anaconda3\\python.exe -u \"$file\"", "file_regex": "^[ ]*File \"(...*?)\", line ([0-9]*)", "selector": "source.python", "env": {"PYTHONIOENCODING": "utf8"},}
键盘ctrl+S另存为，重命名为python38.sublime-build
设置默认执行python3的版本，如下步骤勾选。
设置python脚本默认打开方式为sublime。选择一个python脚本文件（没有的话新建一个txt文件，重命名将后缀修改成.py即可），右键选择打开方式-选择其他应用，找到sublime，勾选始终使用此应用打开.py，点击确定。
运行脚本。双击打开python脚本后，键盘Ctrl+B（或在工具栏选择Tools-Build）即可运行脚本。
METHOD 2 （anaconda版）
anaconda是一个开源的Python发行版本，其包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项，因为包含了大量的科学包，Anaconda 的下载文件比较大。无需单独安装python。
下载相应版本anaconda：https://www.anaconda.com/distribution/#download-section
双击安装，一直选择默认即可，安装成功后在电脑开始会有anaconda文件夹，其中Anaconda Prompt类似windows下的命令提示符
同样可以使用sublime编辑，找到anaconda版本下的python路径，参考METHOD 1 步骤5中的配置即可。
使用jupyter lab编辑脚本和文档。点击上一步的Prompt，输入jupyter lab回车，将调用默认浏览器打开编辑器。
jupyter lab是一个交互式的开发环境，使用jupyter lab可以：
可以开启终端，用于交互式运行代码，完全支持丰富的输出
完美支持 Markdown，Python，R，Julia，LaTeX等任何文本文件
增强notebook功能
超多插件支持
对于非python开发人员，是没有必要配置jupyter的，配置好sublime编辑器即可。
今天就这样，peace & love
网友评论