一项刊登在影响因子20.77杂志Gastroenterology上题为“FXR-Dependent Modulation of the Human Small Intestinal Microbiome by the Bile Acid Derivative Obeticholic Acid”的研究报告中，来自梅奥诊所的科学家们在研究OCA对人类和小鼠的影响时,发现了胆汁酸与小肠微生物组特征之间相互作用的证据。 这些发现表明，法尼醇X受体的激活改变了肠道微生物群，并且提供了发现微生物组生物标志物或生物工程化人类微生物组新方法的机会。
肠道细菌可以改变由法尼醇X受体调节的胆汁酸和胆汁酸的组成，影响肠道细菌的存活和生长。他们研究了一种胆汁酸类似物、法尼醇X受体激动剂，苯二酚酸（OCA）对人和小鼠肠道微生物的影响。
研究者对24名健康志愿者进行了I期研究，给予OCA（5、10或25mg/d，持续17天）。在基线（第0天）、第17天（给药结束）和第37天（研究结束）收集粪便和血浆样品。粪便标本通过shotgun基因组测序分析。利用Uniref90的高度严格的基因组分析，将特异基因分配给与OCA相关的细菌的分类学特征。雄性C57BL/6小鼠每天用水、空载体或OCA(10mg/kg)灌胃2周。用生理盐水冲洗并收集小肠腔内容物，在基线和第14天收集粪便颗粒。用16S标记的序列分析小鼠样本，通过培养实验确定胆汁酸和OCA对细菌生长的分类特异性影响。
OCD治疗后血浆C4水平与嗜热链球菌相对丰度的相关性
与OCA施用相关的粪便微生物组的基因组特征
与OCA给药相关的细菌代谢途径
与2种内源性胆汁酸和OCA反应使用OCA最密切相关的2克位菌种的最低抑菌浓度
OCA给药对小肠和粪便中胆汁酸浓度的影响
基于16S标记测序的OCA对小鼠近端和远端小肠和粪便微生物群组成的影响灌胃给药14天后用水（对照），0.5％MC或0.5％MC与OCA 10 mg / kg
通过逻辑回归模型评估的细菌物种的相对丰度的能力来区分OCA处理（第16天）与非处理（第1天和第37天）
设计拦截747-105研究
相对于2个对照，响应于OCA处理的小鼠远端小肠中差异丰富的分类群的盒须图
通过对照，MC和OCA组的定量16S拷贝数聚合酶链反应确定近端小肠，远端小肠和粪便中的细菌负荷
血浆C4水平的功率来预测OCA治疗
OCA抑制了受试者内源性胆汁酸合成，且导致了小肠中的革兰氏阳性细菌可逆诱导，这些细菌是饮食和口腔微生物群的组成部分。他们发现胆汁酸在最小抑菌浓度测定中降低了这些细菌的增殖。在这些生物体中，经过OCA处理的受试者，参与DNA合成和氨基酸代谢的微生物基因组途径的代表性增加。与这些发现一致，与喂食水或空载体的小鼠相比，喂食OCA的小鼠具有较低的内源性胆汁酸水平和较高的厚壁菌的比例，特别是在小肠中。
来源：FXR-Dependent Modulation of the Human Small Intestinal Microbiome by the Bile Acid Derivative Obeticholic Acid.Gastroenterology
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