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R安装rSymPy(依赖rJava)报错的解决方法

R安装rSymPy(依赖rJava)报错的解决方法

作者: p1uxtar | 来源:发表于2018-12-24 10:13 被阅读0次

<2020-06-04>更新。

虽然rSymPy等包并不常用,但是xlsx常见啊,所以还是把这个问题解决了。

因为没用过java语言,所以很多概念比如java和jdk一直都分不太清。最近R包要升级了报错,今天详细看了提示才发现当前的java环境里没有include目录。

比如我现在这台机,虽然默认有java8-openjdk,但仍需要安装jdk,当前对应的版本是14,环境叫java-14-jdk,这样JAVA_HOME(/usr/lib/jvm/java-14-jdk/)里才有include/jni.h,但是仍然不生效。需要使用sudo archlinux-java set java-14-jdkjava-8-openjdk/jre替换才可以,也可以使用archlinux-java status查看已经安装的java环境及状态。

之后R及包的安装,按照本文继续操作就可以了。


寻找计算数列极限的包,查得有RyacasrSymPy,后者在安装过程中报错。

阅读报错的信息"Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R",此问题可在终端输入:

sudo R CMD javareconf

解决。

此后可以编译却不能加载,原因是缺少 libjvm.so,"package ‘rJava’ could not be loaded"
而我用的Manjaro本就有jdk等,毋须再次安装。只要在 /etc/envirionment 中添加:

LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/default/jre/lib/amd64/server/

重启R即可。

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