常见原因总结，特殊情况除外。
一、问题来源
在分析性能问题的时候慢查询和binlog慢事务是常用的手段。最近在分析一个慢查询的，发现其中包含了大量的commit语句慢，但是在分析binlog慢事务的时候不能完成匹配。比如这段时间commit的语句可能有1000个，但是慢事务可能只有100个，这个差得也太多了。那么为什么会出现这种现象呢？
二、各自的判定方式
- 慢事务
对于一个显示提交的(insert)事务通常如下：
- GTID_LOG_EVENT和XID_EVENT是命令‘COMMIT’发起的时间。
- QUERY_EVENT是第一个‘Insert’命令发起的时间。
- MAP_EVENT/WRITE_ROWS_EVENT是每个‘Insert’命令发起的时间。
因此我们通常通过XID_EVENT的时间减去QUERY_EVENT的时间就得到了一个慢事务时间，当然如果是自动提交的则不能这么计算，因为各个event都是语句发起的时间。
- commit 慢的可能性
我们知道commit慢最可能的地方在binlog的刷盘或者等待半同步从库ACK，但是binlog中XID EVENT的时间却不包含这部分时间，也就是说binlog慢事务和慢查询中的commit记录的不是一个时间段。
- 简要说明
如果我们以如下事务为例，进行简要说明
begin;
insert into it values(10);
commit;
-- insert语句执行 -> QUERY_EVENT时间(T1)
-- insert语句执行完成,判定insert语句是否为慢查询(T2)
-- commit语句执行 -> GTID_LOG_EVENT和XID_EVENT时间(T3)
flush
fsync
-----> 传输binlog (sync_binlog=1)
<---- 等待ACK (rpl_semi_sync_master_wait_point=AFTER_SYNC)
commit
-- commit语句执行完成,判定commit语句是否为慢查询(T4)
- 判定insert语句是否慢的标准是T2-T1(-锁时间)
- 判定commit语句是否慢的标准是T4-T3
- 判定慢事务的标准是T3-T1
因此慢事务的判定和慢查询中commit慢的判定几乎没有什么交集，因此出现这种情况也是正常的，下面来证明。
三、证明
- 主库:半同步超时时间为999999999，
- 从库:设置sync_relay_log=1,并且断点设置在MYSQL_BIN_LOG::flush_and_sync
这样人为在断点处等待一下就显著的拉长了commit的时间，同时也证明半同步慢会影响commit慢，如下：
begin;
select now(); -T1
insert into it values(10);
select sleep(10);
select now(); -T2
commit; (断点在从库生效卡主ack) -T3
select now(); -T4
结果
mysql> begin;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
mysql> select now(); -T1
+---------------------+
| now() |
+---------------------+
| 2022-06-12 22:20:43 |
+---------------------+
1 row in set (0.00 sec)
mysql> insert into it values(10);
Query OK, 1 row affected (0.10 sec)
mysql> select sleep(10);
+-----------+
| sleep(10) |
+-----------+
| 0 |
+-----------+
1 row in set (10.01 sec)
mysql> select now(); -T2 AND T3
+---------------------+
| now() |
+---------------------+
| 2022-06-12 22:20:54 |
+---------------------+
1 row in set (0.00 sec)
mysql> commit;
Query OK, 0 rows affected (21.64 sec)
mysql> select now(); -T4
+---------------------+
| now() |
+---------------------+
| 2022-06-12 22:21:15 |
+---------------------+
1 row in set (0.00 sec)
我们来分析一下慢查询和binlog，这里加入了sleep(10)拖长了事务commit时间，因为insert太快了。
- binlog慢事务 22:20:54(T2) - 22:20:43(T1) = 11秒左右(我们加入了sleep(10))
# at 12221
#220612 22:20:54 server id 613306 end_log_pos 12286 CRC32 0x3e019332 GTID last_committed=40 sequence_number=41 rbr_only=yes
/*!50718 SET TRANSACTION ISOLATION LEVEL READ COMMITTED*//*!*/;
SET @@SESSION.GTID_NEXT= '00320cc8-39f9-11ec-b5ba-000c2929706d:41'/*!*/;
# at 12286
#220612 22:20:43 server id 613306 end_log_pos 12360 CRC32 0x8dcde193 Query thread_id=43 exec_time=1 error_code=0
SET TIMESTAMP=1655043643/*!*/;
BEGIN
/*!*/;
# at 12360
#220612 22:20:43 server id 613306 end_log_pos 12409 CRC32 0x0db68582 Rows_query
# insert into it values(10)
# at 12409
#220612 22:20:43 server id 613306 end_log_pos 12456 CRC32 0x363a48c7 Table_map: `mysemi`.`it` mapped to number 124
# at 12456
#220612 22:20:43 server id 613306 end_log_pos 12496 CRC32 0xd44e43f3 Write_rows: table id 124 flags: STMT_END_F
### INSERT INTO `mysemi`.`it`
### SET
### @1=10 /* INT meta=0 nullable=1 is_null=0 */
# at 12496
#220612 22:20:54 server id 613306 end_log_pos 12527 CRC32 0x4d8d2c64 Xid = 547
COMMIT/*!*/;
- 慢查询中的commit慢 22:21:15(T4) - 22:20:54(T3) = 21秒
# Time: 2022-06-12T22:21:15.746223Z
# User@Host: root[root] @ localhost [] Id: 43
# Schema: mysemi Last_errno: 0 Killed: 0
# Query_time: 21.641090 Lock_time: 0.000000 Rows_sent: 0 Rows_examined: 0 Rows_affected: 0
# Bytes_sent: 11
SET timestamp=1655043675;
commit;
这里很显然了慢查询记录的commit慢明显不包含在慢事务中。
四、总结
基于如上我们稍微做下总结，并且加上我们常有的认知，总结如下：
- binlog慢事务中有记录，慢查询没有记录，可能事务中有大量的锁等待信息或者是事务没有及时提交。
- 慢查询有记录，binlog慢事务中没有记录，可能语句本生为自动事务提交，自动提交的事务无法计算慢事务。
- 如果确实是DML语句慢(排除加锁时间)导致的慢事务并且为显示(begin;commit)事务才会同时出现在binlog慢事务和慢查询中。
- 慢查询中出现commit慢和binlog慢事务没有必然的关系，因为记录的时间完全不同。
- 半同步慢ACK和日志刷盘慢会影响到commit慢，都会记录到慢查询（MGR before commit hook 处理慢也会）。
- 如果binlog慢事务和某些慢查询中的select语句时间匹配则可能是事务中包含了select语句导致。
当然这只是常见的总结，很多特殊原因不好说，需要pstack等手段确认。
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