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「Debug R」有些你认为的报错不是报错(error),是警告

「Debug R」有些你认为的报错不是报错(error),是警告

作者: xuzhougeng | 来源:发表于2019-04-01 12:19 被阅读181次

    在学员答疑群里看到这样一条提问:

    提问

    对于这种提问,我只想给出一张深藏已久的图作为回复。

    警告和报错

    「Debug R」报错"unable to find an inherited method for function"是如何产生的文章中,我提到一个好的搜索引擎是解决问题的重要因素,于是他也在提问中也提到自己用了谷歌。

    虽然搜索引擎能够帮助我们处理大部分问题,相当于人的外脑,但是有一个功能是搜索引擎还无法做到,就是“思考”。他这个不算报错的“报错”就需要一定的思考,让我们先对警告信息进行翻译,

    警告信息: 在tibble设置行名已经弃用(deprecated)

    这里的关键字是弃用(deprecated), 在软件迭代过程中,作者会慢慢把一些功能取消掉,这些被取消的功能在被调用时就会有该提示。从这个信息中,我可以推断出,提出这个问题的人在用tidyverse系列的R包,并且在使用过程中将 原本的 data.frame 数据结构转成了 tibble 数据结构。

    现在,让我们来复现这个问题(为了区分输出信息和代码,R代码部分用>提示,运行时需要删掉)

    > library(tibble)
    > mtcars <- as_tibble(mtcars)
    > rownames(mtcars) <- paste0("Car_", seq(1,nrow(mtcars)))
    
    Warning message:
    Setting row names on a tibble is deprecated
    
    > head(mtcars, n=2)
    # A tibble: 2 x 11
        mpg   cyl  disp    hp  drat    wt  qsec    vs    am  gear  carb
      <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
    1    21     6   160   110   3.9  2.62  16.5     0     1     4     4
    2    21     6   160   110   3.9  2.88  17.0     0     1     4     4
    

    那么问题如何解决呢?有两种方式, 第一种是将 tibble 用 as.data.frame转回成数据框结构,但我不推荐,因为这违背了tidyverse的设计思想,而且后续你还在调用dplyr的函数还会遇到行名丢失 的问题

    > mtcars <- as.data.frame(mtcars)
    > rownames(mtcars) <- paste0("Car_", seq(1,nrow(mtcars)))
    > head(mtcars, n=2)
          mpg cyl disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
    Car_1  21   6  160 110  3.9 2.620 16.46  0  1    4    4
    Car_2  21   6  160 110  3.9 2.875 17.02  0  1    4    4
    

    另一种方法,新增一列存放行名

    > library(tibble)
    > mtcars <- as_tibble(mtcars)
    > mtcars$rownames <- paste0("Car_", seq(1,nrow(mtcars)))
    > head(mtcars, n=2)
    # A tibble: 2 x 12
        mpg   cyl  disp    hp  drat    wt  qsec    vs    am  gear  carb rownames
      <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <chr>   
    1    21     6   160   110   3.9  2.62  16.5     0     1     4     4 Car_1   
    2    21     6   160   110   3.9  2.88  17.0     0     1     4     4 Car_2 
    

    这种解决方法才是tidyverse系列包所喜欢的样子。

    hoptop -- 可能是中国在现场处理过R语言报错最多的人

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