美文网首页生信星球培训第四期
学习小组Day5笔记--郝志刚

学习小组Day5笔记--郝志刚

作者: 马连洼小法师 | 来源:发表于2018-09-07 17:52 被阅读12次

R语言学习

思维导图

1 向量

元素指的是数字或者字符串(用chr表示)
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量

1.1 向量赋值:

x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意这里是逗号不是分号)
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

赋值

1.2 向量取值

(1)根据元素位置

x[4]#x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

image.png

(2)根据值的大小

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

image.png

2 数据框

2.1 读取

X<-read.csv('doudou.txt')

2.2 设置行名和列名

colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header=T,row.names=1)
最后row.names的意思是修改第一列为行名

image.png

2.3 数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)

image.png

2.4 变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令

保存与加载

2.5 提取元素

X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]第y列(横着写)
X[y] #第y列(竖着写)
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列

image.png

2.6 直接使用数据框中的变量

2.6.1 attach

c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))#创建数据框
attach(c)#将数据框名添加到搜索环境中
plot(case,values)#作图
detach(c)#将c删除出搜索变量

image.png
2.6.2 with

with(c,{
plot(case,values)
x<<-summary(values)
})
x #运行完后打印x
统计并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了with循环仍有效。
with后的大括号只有大括号内有效,出了大括号,无效。如果需要创建在with()结构以外的对象,则要使用<<-替代<-

image.png

相关文章

网友评论

    本文标题:学习小组Day5笔记--郝志刚

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/dmbcgftx.html