clean reads是raw reads过滤后的序列片段合集。clean base (bp) 是clean reads的统计量，相应的raw base (bp)是raw reads的统计量。一般clean reads与raw reads只是一个描述性短语，没有统计量的意思，但就该例而言（Table 1），clean reads代表了经过滤处理后的有效片段数目。于是当采用双端150bp测序时，clean base=clean reads*read length*2。
案例来源：华大测序报告
clean reads是raw reads过滤后的序列片段合集。clean base (bp) 是clean reads的统计量，相应的raw base (bp)是raw reads的统计量。一般clean reads与raw reads只是一个描述性短语，没有统计量的意思，但就该例而言（Table 1），clean reads代表了经过滤处理后的有效片段数目。于是当采用双端150bp测序时，clean base=clean reads*read length*2。
案例来源：华大测序报告
问题是，二代下机数据的Raw Reads乘以测序长度后为什么不等于Raw Base？ Raw Reads简称为RR...
01_clean_qc (can ke skipped)trims 接头序列和 deletes低质量的reads，...
yum clean all yum --enablerepo=base clean metadata yum --...
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for i in *_clean_R1.fq.gz;do base=$(basename $i _clean_R1...
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perl ReadsCount2rpkm.tpm.pl ../raw_reads/TCGA_BLCA_RESM_s...
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一、简介 Raven是三代raw reads的组装软件。它首先通过 chaining minimizer hits...
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本文标题：clean reads/clean base、raw reads
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/dnboldtx.html
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