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二代一些过滤软件

二代一些过滤软件

作者: 日月其除 | 来源:发表于2023-08-20 15:01 被阅读0次

    fataqc后可能需要对reads进行过滤
    看文献总结一些相关软件
    fastqmcf (v1.0)


    image.png

    TrimGalore


    image.png

    参考
    https://www.jianshu.com/p/8af59c56e879
    cutadapt 软件可以对NGS数据进行质量过滤
    FastQC 软件可以查看NGS数据的质量分布
    trim_galore 将这两个软件封装到一起,使用起来更加方便

    比较推荐的 一款 能自动检测接头 自动去掉不好的reads 自动生成检测报告
    fastp

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