学习小组Day7笔记--素还真

tidyr包的使用

它的功能主要有：
（1）数据框的变形
（2）处理数据框中的空值
（3）根据一个表格衍生出其他表格
（4）实现行或列的分割和合并
　　这个包是把你要用的数据处理成标准而统一的数据框，然后才能进行进一步的数据处理和作图

1.安装包的方法： install.packages("包名")

示例：

install.packages("tidyr")

为了能够快速下载并安装包，我们最好将包的获取地址改为国内的服务器，操作如下：

在使用的时候需要首先将包载入：library(tidyr)

准备工作

新建数据框：

a<-data.frame(GeneId = rep("gene5",times=3),SampleName =paste("Sample",1:3,sep=""),Expression=c(14,19,18))

结果显示为：

GeneId =,SampleName= ,Expression= #表示列明

rep()函数
rep(x,times)   #表示重复x多少次
例如：
> rep("a",3)
[1] "a" "a" "a" #显示结果

paste()函数，是将两个变量连接起来的函数
#用法：
paste (..., sep = " ", collapse = NULL)
示例：
> paste("1st", "2nd", "3rd")
[1] "1st 2nd 3rd"   #显示结果
有两个参数：
sep：表示连接的两个字符之间以什么连接起来
collapse：是表示将初步连接起来的结果，以什么连接
示例：
 paste(c(1,1),c(2,2),sep="")
[1] "12" "12"
paste(c(1,1),c(2,2),sep=",")
[1] "1,2" "1,2"
> paste(c(1,1),c(2,2),sep=",",collapse = ":")
[1] "1,2:1,2"
#注意
当连接的变量的只包含1个常量时，,collapse 是不起作用的
示例：
> paste("1st", "2nd", "3rd", collapse = ", ")
[1] "1st 2nd 3rd"

c()函数表示创建向量

注意： 字符串要加双引号（行名和列名也是字符串，但是可以不用加），其他单元格（姑且这么叫了）里出现的字符串要加。

TidyData

这是一种组织表格数据的方式，提供了一种能够跨包使用的“统一”的数据格式

1.Reshape Data

> a<-data.frame(country = c("A","B","C"),"1999" = paste(c(0.7,37,212),"K",sep = ''),"2000" = paste(c(2,80,213),"K",sep = ''))
> a
  country X1999 X2000
1       A  0.7K    2K
2       B   37K   80K
3       C  212K  213K

> gather(a,X1999,X2000,key = "year",value = "cases")
#gather(表名,合并列1,合并列2,合并后的key列名,value列名)
  country  year cases
1       A X1999  0.7K
2       B X1999   37K
3       C X1999  212K
4       A X2000    2K
5       B X2000   80K
6       C X2000  213K
5       B X2000  80 K
6       C X2000 213 K

gather(a,"year","cases",X1999,X2000) #另一种写法

2.Handle Missing Values