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以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章,现在整理为流程,同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析...
入门引言 以转录组学为例,上游分析基于linux,包括质控、过滤、比对、定量,下游分析基于R语言,包括差异分析、富...
之前已经写过长篇RNA-seq完整分析过程,本文将介绍采用不同比对软件进行比对,然后采用相同的定量软件进行定量;相...
传统转录组的分析想必大家已经非常熟悉,无非是质控 -> 比对 -> 组装 ->定量 -> 差异分析 -> 差异表达...
欢迎关注”生信修炼手册”! 在转录组的数据分析中,定量和差异分析是基础分析内容,对于mRNA的定量,直接将read...
写在前面 前面的流程,我们已经可以 得到原始数据(下载或者自己测序) 质控和比对 定量 得到差异表达分析 差异表达...
经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通...
外显子定量 可视化 DEXSeq包是用来分析RNA-seq实验数据中exon的差异;这里exon的差异指的是由于实...
转录组分析总体流程如图所示,主要分为上游分析(原始数据质量控制、比对、组装、定量),下游分析(差异分析、富集分析)...
整理毕业论文数据的时候,想将RNA-seq上游的一些分析结果可视化,主要是比对和定量的结果,通过图表展示反而没有那...
本文标题:生信入门第八课:RNA-seq比对、定量和差异分析
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/dyhdjjtx.html
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