第20周 2018— 9.30-10.6
题目：Simultaneous profiling of DNA methylation and chromatin architecture in mixed populations and in single cells
DOI (url) : http://dx.doi.org/10.1101/470963
发表日期：Nov. 14, 2018
发表杂志：bioRxiv
关键词： Methyl-HiC
概述
这篇文章是任兵实验室11月14日在线发表在bioRxiv, 今天有幸听到了Yaping Liu博士对这篇文章的解读。文章主要介绍了一种新的方法——Methyl-HiC，整合了situ Hi-C和WGBS两种方法，可以在单细胞水平同时检测染色质结构和DNA甲基化。
这篇文章的亮点我认为有两方面：
- 一是他们的方法可以同时检测甲基化和染色质结构，而以往的研究都是分开进行的；
- 二是可以在单细胞水平上实现，据说单细胞的Hi-C目前挑战都很大，但是他们的methyl-HiC却可以实现在单细胞水平上同时观测甲基化和染色质高级结构的变化。
- 此外他们提供了对应的分析方法
Bhmem以及所有分析的源代码：https://bitbucket.org/dnaase/bisulfitehic/src/master/
研究方法总览
The workflow of Methyl-HiC
分析方法——bhmem
结果验证
总结
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