参考链接:https://www.biomart.cn/experiment/430/443/447/2609295.htm
microRNA后带有星号和不带有星号的代表什么意思,例如miR-200a与miR-200*?
没有星号代表的是成熟miRNA的主要产物
When the relative abundancies clearly indicate which is the predominantly expressed miRNA, the mature sequences are assigned names of the form miR-56 (the predominant product) and miR-56* (from the opposite arm of the precursor).
当相对丰度清楚地表明哪个是主要表达的miRNA时,成熟序列被指定为miR-56(主要产物)和miR-56 *(来自前体的相对臂)的名称。就是说不带信号是主要产物,带星号是副产物
关于microRNA的命名规则:
(1)miRNA 简写成miR,再根据其被克隆的先后顺序加上阿拉伯数字,如miR-21;
(2)高度同源的miRNA 在数字后加上英文小写字母(a、b 、c),如miR-199a 和miR-199b;
(3)由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA,则在后面加上阿拉伯数字以区分, 如miR-199a-1 和miR-199a-2;(4)如果一个前体的2 个臂分别加工产生miRNA,则根据克隆实验,在表达水平较低的miRNA 后面加“”,如miR-199a和miR-199a,或进行如下命名,miR-142-5p(也可命名为miR-142-s,表示从5' 端的臂加工而来)和miR-142-3p(也可命名为miR-142-as,表示从3´端的臂加工而来);
(5)将物种缩写置于miRNA 之前,如hsa-miR-1 9 5 ;
(6)确定命名规则之前发现的miRNA,如let-7,则保留原来名字。
miRNA前体两臂上产生的两个miRNA,研究者将丰度较低的miRNA加以“*”标记,而当前未通过实验确定丰度高低的,以诸如miR-142-5p(5‘臂)和miR-142-3p(3‘臂)这种命名形式来区分。
这里丰度指检测到的miRNA表达量。星号与否其实是两个不同的miRNA基因了,功能也是很不同的。
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