学习小组Day3笔记-Iris

我类个擦，看着今天的内容我就不想打开电脑看……所以带着师妹做实验……然后就晚了。废话不说了，赶紧干活儿，害怕如果有用的话，那我就天天呆在宿舍做噩梦了。
1.首先明白需要下载一个bzip2，我的理解就是打开压缩包的一个命令，这个是基础，所以就下载喽……（bzip2）……报错，说明没有……安装（yum install -y bzip2 ）……出现complete即可。
2.下载软件商店miniconda，百度搜索，“miniconda安装”……如何查看自己的电脑是多少位？（电脑里搜索DXDIAG）……你看看百度真的可以解决百分之九十的问题……我的是64位。下载linux下的64位miniconda，结果无法和教程中一样右击复制链接，因此就选择新窗口打开“https://conda.io/miniconda.html”……下载的时候wget（空格！！！！）左击是复制，右击就是粘贴。

1.png
第一遍的图被百度坑了，查的是32位的，因此就安装32位的。下载完，安装的时候没有看到，结果跟教程不一样，我就迷惑了。往上翻，里边有提示我的是64位的。
关掉，重新安装 3.png

上图有sh即为下载成功，若安装失败（安装），不用重新下载
3.安装miniconda：bash(空格)+单引号中包括sh的一堆……yes—……
注意：ls(l是L的小写)来搜索文件，rm -rf删除文件，具体流程见表。
确实有点儿难了……想哭

思维导图.png
4.安装结束
5.看看自己的环境“conda 环境”-----查看环境“conda info --envs”----显示如下 1.png
6.如果要处理RNA-seq数据，则建立一个名叫rnaseq的conda环境，且指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic（这两个可以一步完成）
命令为：conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
显示如下： 2.png
7.再次查看环境：conda info --envs
显示如下： 3.png
多了一个rna-seq,默认仍为base需要激活！！！！“source activate rna-seq”，显示如下：
注意*的变化
8.输入fastqc，仅仅是查看，无其他命令执行。 5.png
9.卸载软件：
•如何卸载一个环境中的软件
◾卸载某个软件conda remove -n rna-seq fastqc -y
◾全部卸载，也就是卸载这个环境conda remove -n rna-seq --all
◾注意：最后卸载环境的时候，需要先退出当前环境，因为自己肯定不能把自己删除吧
我复制了卸载某个软件的命令，即可删除。
但是复制了全部卸载，即卸载整个环境，就会出现 6.png
百度了一下如何退出环境，但是没有百度到，因此放弃了。就不下载环境了吧。