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基因工程小鼠的命名规则

基因工程小鼠的命名规则

作者: 谢京合_数据分析人 | 来源:发表于2022-02-28 11:02 被阅读0次

最近,读了几篇肿瘤转移相关文献,出现了各种基因修饰小鼠的名字。
看着一堆眼花缭乱的编号,还带着各种上标和符号。很多不太好理解。
所以,专门查了一下命名规则及具体说明。

这里就搬运一下,“男模生物”
里面介绍了各种小鼠的命名规则,以及很多公司已经有的小鼠。
【小鼠大学问】基因工程小鼠的命名规则|南模生物 (modelorg.com)

看的时候里面有些不理解。
所以再加一些备注。

什么是Cre工具鼠?
由转基因或基因敲入手段建立,将Cre重组酶整合到小鼠基因组中,可以特异识别重组酶识别位点(例如:LoxP位点),从而使我们需要的flox小鼠发生时空特异性敲除或敲入的小鼠就是我们的Cre工具鼠。

什么是LoxP位点:Cre-loxP 基因重组技术 - 实验方法 - 丁香通 (biomart.cn)
这里有解释。

为什么要用到Cre工具鼠
CKO(Conditional Knock Out)小鼠相对于KO(Knock Out)小鼠来说有以下几点优势:
1.可以用于具有胚胎致死性目的基因的研究;
2.可以用于研究基因在特定的组织或细胞中的生理病理功能;
3.通过与控制Cre或Flp表达的其它诱导系统相结合,还可以对某一基因的表达同时实现在时间和空间两方面的调控。为了实现各位研究者对于基因的条件性表达,将我们的CKO小鼠与Cre工具鼠交配后即可实现这一目的。

什么是Flox小鼠?
定义:条件性基因敲除小鼠(也叫Flox小鼠)是指在目的基因中含有成对的loxp位点的小鼠,与Cre工具小鼠交配后可在特定的组织或细胞中敲除目的基因。

集合这些资料:基本上了解个七七八八。
具体细节再自行百度。

有的时候我们除了关心一个基因的功能外,还想知道表达目的基因的这类细胞在体内是什么作用。

那么怎样才能在体内把一群细胞剔除掉呢?

这时候 [DTR]小鼠就能大展身手啦。
DTR 小鼠是通过基因编辑让目的细胞表达白喉毒素受体(Diphtheria toxin receptor,简称DTR),然后通过注射白喉毒素(Diphtheriatoxin,简称DT)实现细胞的条件性剔除。

sgRNA是什么?
sgRNA(small guide RNA)是向导RNA(guide RNA,gRNA),在RNA编辑的过程中引导尿苷残基插入或缺失到动质体(kinetoplastid)中,属于一种小型非编码RNA,可与[pre-mRNA]配对。gRNA编辑RNA分子,长度大约60-80个[核苷酸],由单独的基因转录。

sgRNA 是大名鼎鼎的基因编辑神器 Cas9 系统的“指挥中心”,可以引导 Cas9 对 DNA 进行定点编辑。

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