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pip安装pysam出错

pip安装pysam出错

作者: 白菜代码小推车 | 来源:发表于2019-09-22 16:27 被阅读0次

mac或者linux中有时候安装pysam会报错。在windows中安装这个模块基本上都是报错的,因为这个工具里面用到的模块samtools可能是在linux系统中才行。

  • 尝试一下指定版本安装
pip install pysam==0.9.1
  • 或者下载下来之后再安装
pip install https://github.com/pysam-developers/pysam/archive/master.zip
  • 或者是在bioconda中使用conda安装
conda install -c bioconda pysam

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