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2019-01-06

2019-01-06

作者: Mingyan_C | 来源:发表于2019-01-06 23:01 被阅读0次

19.有研究表明:用siRNA干扰BAF200(Arid2)可以减少IFNα干扰素诱导的跨膜蛋白1(IFITM1)的表达,但不影响其他干扰素调节基因的表达。鉴于这种T细胞衍生的细胞因子对肿瘤免疫的重要性,该研究系统地检测了PBAF复合物是否调节基因表达以应答IFNγ。RNA-seq分析Arid2和Pbrm1缺陷型细胞系的转录组。

BAF复合物和PBAF复合物具有共同的核心亚基(绿色标记部分),但是BAF复合物的特殊组份是ARID1A/B,而PBAF复合物的特殊组份是PBRM1,ARID2和BRD7。

结果表明了Arid2和Pbrm1减弱了B16F10肿瘤细胞对γIFN的应答能力,而γIFN是T细胞对肿瘤细胞的关键效应因子。

图A和图B中可以看到与对照组细胞相比,Arid2和Pbrm1缺陷型细胞系中共同上调的基因集中应答γIFN和αIFN的基因显著富集,说明了Arid2和Pbrm1能够抑制应答干扰素的基因表达

图C:在热图中,与对照组细胞相比,Arid2和Pbrm1缺陷型细胞系中抗病毒反应的基因和T细胞趋化因子的基因表达上调。

图D为在IFNγ处理细胞24h后提取细胞总mRNA,进行实时荧光定量PCR检测Pbrm1缺陷型细胞系中Cxcl9mRNA水平,从图中可以看到与对照组细胞相比,Pbrm1缺陷型细胞系中Cxcl9mRNA水平显著升高。

图E为ELISA实验检测IFNγ处理24h后细胞上清液中趋化因子的含量,从图中可以看到与对照组细胞相比,Pbrm1缺陷型细胞系中Cxcl9蛋白分泌量显著增加。

图F也为ELISA实验检测IFNγ处理之后细胞上清液中趋化因子的含量,与对照组细胞相比,Pbrm1缺陷型细胞系中Cxcl10在0.1ng/ml-1ng/ml范围的IFNγ刺激下,随着IFNγ浓度的增加,分泌趋化因子Cxcl10增多。

为什么该研究只分析了Pbrm1缺陷型细胞系分析中Cxcl9和Cxcl10的分泌情况而不选择Arid2或者两个都分析呢?

个人认为在图C的热图中,Cxcl9和Cxcl10在Arid2缺陷型细胞系中表达上调程度比Pbrm缺陷型细胞系明显,所以只要证明了Cxcl9和Cxcl10在Pbrm缺陷型细胞系中分泌增加,就说明其在Arid2缺陷型细胞系中的分泌也增加。

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