美文网首页
改名+压缩

改名+压缩

作者: rong酱 | 来源:发表于2020-09-17 20:38 被阅读0次
    for i in `ls ./raw_data/*/*.fq.gz`
    do
            sample_name=`echo $i | awk -F "/" '{print $NF}' | awk -F "." '{print $1}'`
            sample=`echo $i | awk -F "/" '{print $NF}'`
            cd ${path}
            mkdir ${sample_name} 
            cd ${sample_name}
            ln -s $i ./
            zcat ${sample} | split -16000000 
            count=0
            for z in `ls x*` 
            do
                    count=$((${count}+1))
                    /bin/mv ${z} ${sample_name}_00${count}.fastq
            done
    done
    

    创建目录
    链接
    解压分割
    改名

    相关文章

      网友评论

          本文标题:改名+压缩

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/ffyryktx.html