前面提到的病理机制中的易感因素，有不同的原因造成，生物学的、心理学的以及社会环境的，比如一个孩子的体质中有遗传因素，让其易感，还有母体怀孕、生长发育、成长经历过程中受到不良环境因素的影响，可能改变这些素质。我们先来看生物学机制。
一、遗传学机制
抑郁症与二旋糖尿病的遗传机率差不多，在30-40%。这个研究结果2016年，发表在英国的《自然》（《Nature》，CNS，Cell，Nature，Science三大杂志之一）上，75607个抑郁障碍样本与231741无抑郁史样本对照，发现5个（染色体）位点有显著性（P值小于10-8）；选择P值小于1.0X10-5（45773名转折，106354名对照），进一步发现，15个位点有限制性差异。
那得抑郁症是不是就是这五个位点引起的呢？不一定。可以再来看看2018年的一个研究：135458抑郁症患者/34490健康对照基因组。研究发现，抑郁症患者的遗传特点与健康人不一样，有44个基因位点有差异，那是不是这44个基因位点导致了抑郁症呢？不一定。首先，这些基因位点，在精神分裂症、双相障碍、进食障碍等疾病里，也有类似的差异，这就造成了一些困惑：是不是这些基因位点跟人的精神疾病的易感素质有关、而不仅仅是跟抑郁症的易感素质有关呢？抑郁症是不是有特异性基因？现在还不知道，但是我们至少知道了它与健康人的遗传特点不一样，同时，其遗传特点与其他精神障碍有一些共同点。
下面看另一个700个样本的研究
700个精神疾病患者样本的基因研究
研究说明：
精神分裂症与双相情感障碍的重叠性达到75%；精神分裂症与抑郁症有20%多的重叠性；双相情感障碍与单纯抑郁症有25%的重叠性。
另外一个发在CELL上的研究报告，23万个患者样本，接近50万健康样本对照，患者包括精神分裂、双相情感障碍、抑郁症、抽动症、孤独症、强迫症、进食障碍、多动症、神经性厌食等9种疾病的患者。结果表明，九种病可以分为三类：精神分裂、双相情感障碍与抑郁症，遗传重叠性（病理性基因的重叠性）、一致性很高；进食症、抽动症、强迫症的重叠性很高；抽动症、孤独症的重叠性高。
研究结论是：抑郁症肯定有遗传特质，但是其如何遗传的具体机制尚无最终结论。可能需要更大样本（比如100万个），分成不同亚类进行深入分析，寻找有代表性的遗传特质，这是今后的研究需要深入的。
二、免疫学机制
抑郁症是炎症吗？1995年，M Maes就发现抑郁症患者血清白细胞介素-1受体拮抗剂（IL-1-rA）水平高于正常人。一项纳入29项研究的累积荟萃分析结果表明：抑郁患者血清中的两个炎性因子——IL-6（白介素6）和CRF（C-反应蛋白）的水平高于健康人群。抑郁症会影响免疫系统的变化。
2018年的研究表明，抑郁症患者体内的炎性标记物可以预测抑郁症的治疗效果，比如抑郁症患者身体里的炎性标记物叫白细胞介素6，这个指标升高，对抗抑郁药物的效果不好。炎性反应大的抑郁症患者的药物疗效不好。心理咨询的效果如何，现在还没有研究。心理咨询和心理治疗是恢复其自我减压、自我调整的功能。
非甾体抗炎药（塞来昔布等）治疗抑郁症研究
研究表明，抑郁症患者18种抗炎、促炎因子都升高。抑郁症患者的免疫反应处于升高或者紊乱的状态。一些常见抗炎药有抗抑郁的效果，这是调整患者体内的免疫反应。
关于为什么炎性免疫系统的变化会发生抑郁呢？暂无研究结论，相关假说有：
抑郁症的炎症机制假说：神经小胶质细胞
体内炎性茵子增高的时候，头部的小胶质细胞增加和活跃，正常状态下，这种细胞是静息状态，这个时候蠢蠢欲动。神经胶质细胞在神经递质5-羟色胺的变化过程中、合成代谢分解的过程中非常重要，这种神经递质又跟抑郁症的关系非常密切，其前身是色氨酸。在小胶质细胞受到炎症和精神应激的影响下，色氨酸变成喹啉酸（一种刺激谷氨酸受体，NMbA受体过度兴奋的时候，就容易抑郁。
炎性反应与精神疾病
68个急性期（S40,B10,M18三种）和46个慢性期（S18,B16,M12三种）研究，发现一些共性：几种炎性因子（IL-6,TNF-a,SIL-2R,在三种急性期患者中均增高；IL-6在三种慢性患者中均增加；治疗后，IL-6在分裂症与抑郁症患者中显著性下降。研究报告认为，三种精神疾病可能有共同的免疫功能失调。
三、神经生化学机制
抑郁症是神经生化紊乱吗？5-HT/NE/DA。2011年一篇学术文章显示，目前跟抑郁障碍有关的有5种神经递质——5=羟色胺、多巴胺、去甲肾上腺素、谷氨酸、GABA-氨基丁酸。目前的主要药物治疗主要是将神经递质中的5-羟色胺或者去甲肾上腺人为地通过药物增加，或是某些区域多巴胺增加。这是目前相关药理学的基础。
前面的研究表明，穷尽现有的方法，也只有60%左右患者的病情得到了控制，因为上述五种神经递质，只有两种得到针对性药物。2019年，美国上市了两种新药：一个是5-羟色胺受体的阻断剂，S-Ketamine，右旋的氯胺酮（氯胺酮是导致成瘾的兴奋剂，其右旋体用来治疗抑郁，效果较好），受疫情影响，尚未在中国上市。另一个是GABA-氨基丁酸这个系统，有一个治疗产后抑郁的注射剂，2天以后可以改善症状，疗效持续30天以上。伴随针对五大系统的研究越来越多，针对抑郁症的药理学手段会更多。
四、影像学机制
目前，关于抑郁症的神经环路的研究，主要围绕在脑的前部，虽然关于后脑和小脑的报告也有，主要还是围绕前面的前额叶边缘系统、海马、杏仁核三个区域。
抑郁症的环路研究
图解：
蓝色是大脑前额叶内侧和外侧面，浅黄色区域是边缘系统，最下面是杏仁核和海马，形成相互连接的环路。作者认为，杏仁核、海马是情绪的原始系统，是复发的、冲动性的；到了边缘系统，前额叶的眶回、前扣带这些地方，是情绪的自动调节系统（下意识）；前额叶的内侧和外侧面是情绪的主动调节系统。
生物学的分层可以对应于弗洛伊德的潜意识、前意识和意识三个层次，还有本我、自我和超我。相关观点是，要将本我的、潜意识的东西挖掘、疏泄到意识层面。研究认为，抑郁症是前脑的这些区域有异常，但是这些异常是不是抑郁症独有的呢？这又跟前面的遗传学、免疫学、神经生化的问题是一样的道理，这些神经环路的影响跟精神疾病有关系，不仅仅是跟抑郁症有关。分裂症、双相情感障碍、焦虑症等都有这些环路的问题。所以，也需要方法上的优化，研究上的深化，UI中确定抑郁症的神经环路。现在已经有人在从神经环路的角度对抑郁症进行新的分类。
前面讲到抑郁障碍分成六个主要的亚类，其中最典型是抑郁症。针对抑郁症，还可以进一步分类，有没有焦虑、有没有精神病性症状，有沒有忧郁的特点、有沒有双相的特质，是不是发生在怀孕期（围产期），是不是有季节性的特征等等。这是从临床症状和现象来分，是目前流行的分类方法。
现在有人从神经环路的特点对抑郁症进行分类，研究了1188个患者样本，做了功能磁共振影像，然后将这些结果进行机器深度学习，再套回样本，将1188个患者按神经环路特点分成4个亚类，再看四类病人的临床特征。相关研究发布在Lancet Psychiatry杂志。如果这个方向的研究取得更多进展，抑郁症的诊断和治疗又会发展出更多方法。
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