热图绘制

作者: 菠萝_c93e | 来源:发表于2020-03-20 13:34 被阅读0次

pheatmap包学习
热图绘制
热图
热图绘制
热图绘制
热图绘制
获取pheatmap热图聚类后和标准化后的结果
1 初识Complexheatmap
R 热图绘制heatmap①
Reproducing-1-Fig3-B Corrplot 20

setwd("D:/生信学习/热图")
a<-read.csv('jh.csv',header=TRUE,row.names=1)
test<-log10(a+1)
library(pheatmap)
pheatmap(test, scale = "row", clustering_distance_row = "correlation",cluster_col=FALSE ,display_numbers = TRUE,fontsize=8, fontsize_row=6)
#clustering_distance_row = "correlation"列排列为相关性距离
cluster_col=FALSE关闭列排列  display_numbers = TRUE显示数字，fontsize=8 文字大小，

Rplot01.jpeg

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静态与交互式热图： heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3hea...
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从全部差异基因筛选出一定阈值（FC，P值）筛选以后得到差异基因，再从所有差异基因的表达矩阵中筛选出最终差异基因的表...
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先上图 npgene.csv 理化end.CSV同上
获取pheatmap热图聚类后和标准化后的结果
pheatmap是简单常用的热图绘制包，可以快速、简单、可定制的绘制漂亮热图。具体见R语言学习-热图简化和免费高颜...
1 初识Complexheatmap
ComplexHeatmap绘制的热图种类分为： ① Heatmap 类：单个热图，包括热图主体、行/列名称、标题...
R 热图绘制heatmap①
R.package heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3hea...
Reproducing-1-Fig3-B Corrplot 20
分别用两种包:Corrplot和GGally包绘制相关系图热图用Corrplot绘制相关热图安装对应的包cor...