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服务器上安装bioconductor时遇到的问题

服务器上安装bioconductor时遇到的问题

作者: 良田农庄 | 来源:发表于2019-04-20 22:08 被阅读0次

    安装bioconductor这次遇到了很大的问题,一直提示若干其他的问题,
    发现还是网速的和网络链接的问题导致的,时好时不好,
    这里在在服务器中安装conda
    conda下安装最新版本的R(非root伤不起)
    结果一直出幺蛾子
    首先是source不进去,这里就需要修改一下Rprofile的内容了,在R所在的安装路径中使用find指令检索一下该文件存在
    find - name “Rprofile”
    检索到全路径之后就vim加全路径,将清华的镜像添加进去
    options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
    退出之后,source更新一下Rprofile就可以进入R里面使用Biocinstaller了

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