美文网首页
解决安装bioservices包报错

解决安装bioservices包报错

作者: Yayamia | 来源:发表于2022-10-03 17:50 被阅读0次

报错:

(base) [myh@bogon ~]$ pip3.9 install bioservices
Defaulting to user installation because normal site-packages is not writeable
Collecting bioservices
  Using cached bioservices-1.10.3.tar.gz (197 kB)
  Preparing metadata (setup.py) ... error
  error: subprocess-exited-with-error
  
  × python setup.py egg_info did not run successfully.
  │ exit code: 1
  ╰─> [6 lines of output]
      Traceback (most recent call last):
        File "<string>", line 2, in <module>
        File "<pip-setuptools-caller>", line 34, in <module>
        File "/tmp/pip-install-4blslu52/bioservices_34eade18bd69468a9c4a696b661f69e1/setup.py", line 51, in <module>
          with open('requirements.txt', 'r') as f:
      FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'requirements.txt'
      [end of output]
  
  note: This error originates from a subprocess, and is likely not a problem with pip.
error: metadata-generation-failed

× Encountered error while generating package metadata.
╰─> See above for output.

note: This is an issue with the package mentioned above, not pip.
hint: See above for details.

解决方法:
手动下载包的源文件并解压tar.gz
cd到setup.py的路径,发现没有requirements.txt的文件
/home/user/myh/bioservices-1.10.3/src/bioservices.egg-info中找到了requires.txt文件
重命名为requirements.txt并放在setup.py所在路径

报错应该是一个list--删除txt中[test]及下面的内容--pip3.9 install requirements.txt

安装好依赖后,报错没有权限到XXX的安装路径(即默认安装路径在root路径中)。

自定义默认安装路径:
python3.9 setup.py install --root /home/user/myh --prefix /home/user/myh/.local/lib/python3.9/site-packages

安装成功

相关文章

  • 解决安装bioservices包报错

    报错: 解决方法:手动下载包的源文件并解压tar.gzcd到setup.py的路径,发现没有requirement...

  • 安装R包`GenomicRanges`时报错

    安装R包GenomicRanges时报错: 产生这样的报错是因为你在上次安装这个包时发生了意外中断。解决办法——r...

  • R包安装报错-url filed

    问题 安装R包scPred,报错 报错信息 环境 R版本R version 3.4.4 解决方案 直接下载源码包,...

  • Rstudio下安装xlsx rjava

    安装r包---xlsx 1.首先需要安装rjava安装rjava包时报错如下: 解决此问题主要是java路径不对,...

  • docker-compose cannot import nam

    报错信息: 解决办法 查看安装包情况 安装或更新包 参考:docker-compose cannot import...

  • linux安装docker

    docker 安装 安装依赖包 设置阿里云镜像源 安装 Docker-CE 报错 解决办法 启动docker 添加...

  • Jenkins 在 ubuntu 上 安装步骤

    1.在官网上下载jenkins deb 包 使用dpkg工具安装deb包 3.解决报错信息提示: 解决方案:

  • centos安装jenkins

    1. jenkins的下载和安装 1.1 命令安装 命令安装报错解决: 然后运行安装命令 1.2 安装包安装 在h...

  • 【解决pip install 安装报错】No module na

    lixun 安装python包时报错,导致安装pip时也安装不上。 解决办法 linux 上执行 然后重新编译安装...

  • pyhive的安装

    pyhive的安装 impyla连接Hive遇到的坑 安装impala报错及解决办法 以下涉及所有包 Can't ...

网友评论

      本文标题:解决安装bioservices包报错

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/flyeartx.html