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多组学高分文章分析思路解析1 - 蛋白与蛋白糖基化

多组学高分文章分析思路解析1 - 蛋白与蛋白糖基化

作者: 纪伟讲测序 | 来源:发表于2020-12-29 17:09 被阅读0次

    ​     多组学分析是指两个及以上组学,同时做数据分析。通常是同一批样本的多组学分析,常见有基因组、外显子、转录组(含非编码)、蛋白组、磷酸化组、代谢组等,也包含各类修饰组学,如DNA甲基化、m6A、蛋白的各类修饰。 

           近两年的高分组学文章以多组学为主,比如“21分组学文章解析公开课”(B站链接:https://www.bilibili.com/video/BV1dC4y147xu)提到的糖尿病研究,基于蛋白组学和蛋白磷酸化组学的数据关联挖掘分析挖掘胰岛素分泌障碍相关的潜在分子机制;Cancer cell结直肠癌多组学文章解读(B站链接:https://www.bilibili.com/video/BV1bf4y1X7qJ)使用外显子测序、蛋白组学、蛋白磷酸化组学对转移与非转移的结直肠进行比较,寻找差异。

         那么多组学数据应该如何分析呢?多组学文章的一般框架是什么?组学数据如何与临床信息关联,如何相互渗透,如何深入的反应分子之间调控关系。如果给你一批相似的数据,你能否写出20分+的文章?有太多的问题需要思考回答,从本期开始,我们详细交流讨论多组学数据分析挖掘的问题。 

    本周我们先看蛋白组学与蛋白糖基化的联合分析的文献。

    主要讨论内容:

    多组学发高水平文章的基本思路是什么 ? 如何做关联分析 ?

    (1)蛋白质糖基化修饰分析思路,说明什么生物学问题 ?

    (2)如何在临床数据、蛋白表达定量和糖基化修饰水平之间建立关联 ?

    (3)糖基化修饰分析如何揭示分子机制,揭示调控网络 ?

    (4)本篇文章该怎么分析,可以让影响因子提高一个水平?

    以下是视频录屏链接,有需要的老师可以观看。

    B站 超清链接 :https://www.bilibili.com/video/BV1hz4y1r74a


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