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如何读取rda格式数据

如何读取rda格式数据

作者: Jabes | 来源:发表于2019-12-15 19:28 被阅读0次

    Differential Dynamics of the Maternal Immune System in Healthy Pregnancy and Preeclampsia 这篇论文中作者提供了一些数据。
    原始数据放在了 http://flowrepository.org/id/FR-FCM-ZYRQ.不过这个数据格式是流式数据,格式是fcs的,我安装了FlowJo但是解析出错。
    还好,作者也提供了抽取后的特征在这里 https://nalab.stanford.edu/wp-content/uploads/pbmcpedata.zip。但是这个数据提供的格式是Data.rda的,没办法让我导入python去分析。所以这里讲下怎么把R格式的数据导出到csv, 以方便后续数据处理。

    1. 安装R语言包

    Windows安装很简单,直接在https://cran.r-project.org/bin/windows/base/下载最新版的安装包安装即可,

    image.png
    如果做后续开发还可以考虑安装RStudio https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download

    2. 打开安装的R

    搜索R就能找到R X86 3.6.2

    3. 加载数据

    加载很简单,

    test <- load('D:\\project\\Immune-System-Research\\feature_data\\Data\\Data.rda')
    
    image.png
    查看数据
    image.png
    查看表
    image.png

    3.保存数据到csv

    > write.csv(pe,"D://pe.csv")
    > write.csv(GA,"D://GA.csv")
    > write.csv(data,"D://data.csv")
    
    image.png

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