从TCGA下载.json格式文件的转换

基因拷贝数目文件下载下来之后，发现文件名字和TCGA国际认证的命名方式对不上。
所以下载了对应的json文件，发现命名真是乱七八糟。

来吧！写程序提取吧！

这个只是提起我们需要的名称，便于和基因表达量进行关联哈。
这里只是个提取信息的程序，后续详细步骤会进一步更新的。

"""
作者：谢京合
功能：提取json文件当中的信息，并且将其变成列表格式
时间：2020年11月4日
"""


import json

def main():
    """
    main function
    :return:
    """
    my_file = open('metadata.cart.json', encoding='utf-8')
    my_result = open('result.txt', 'w')
    json_data = json.load(my_file)
    # print(json_data)
    for list_data in json_data:
        # print(list_data)
        print(list_data['associated_entities'][0]['entity_id'])
        my_result.write(list_data['associated_entities'][0]['entity_id'] \
                        + '\t' \
                        + list_data['associated_entities'][0]['entity_submitter_id'] \
                        + '\n')

    my_result.close()
    my_file.close()

if __name__ == '__main__':
    main()