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TCGA数据下载遇到的问题

TCGA数据下载遇到的问题

作者: 冬梅_afe6 | 来源:发表于2020-09-08 19:01 被阅读0次

一点前言：学习和操作完全是两回事儿，不实操根本不知道会遇到什么问题。
这里用到的是gdc-client下载数据的方式

问题一

直接用R在控制台输入命令下载，无法调用gdc-client

image.png
问题的解决：gdc-client 应该在Linux下载或者R的Terminal下载
Windows在dos-命令控制符（这里可以参考使用官方gdc-client软件下载TCGA数据）

问题二

使用的gdc-client版本不是最新版本，报错
ERROR: str returned non-string (type Error)

image.png
问题的解决：下载最新版本的gdc-client
感谢生信星球公众号小洁老师对问题的解答。

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      本文标题：TCGA数据下载遇到的问题

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