Linux中的一些小技巧

conda软件的使用：

1、创建虚拟环境：

创建名为xxx的虚拟环境，指定虚拟环境的 Python 版本为3.6
conda create -n xxx python=3.6

!!!注：有时某些软件只能支持低版本的环境，这时就需要我们创建出低版本环境以满足软件要求，如：Python 2.7

2、进入虚拟环境（已创建的）

conda activate xxx

3、退出虚拟环境：

conda deactivate

4、删除虚拟环境：删除名为xxx的环境

conda remove -n xxx --all

5、查看虚拟环境：

conda info --env

6、安装软件：

1、将包安装在默认环境中
conda install -c bioconda xxx

#一般为这个格式，当然为了防止多软件的环境冲突，则可以将其安装在不同环境

2、将包xxx安装在环境env中
conda install -n env xxx

linux加入环境,linux加入环境变量方法

例如：使用conda 环境时每次打开服务器都需要输入

source /home/sll/miniconda3/bin/activate 来进入conda环境

执行vi ~/.bash_profile
修改文件中PATH一行

将source /home/sll/miniconda3/bin/activate加入到
PATH=$PATH:$HOME/bin一行之后

ps命令查看程序开始时间及运行时间：

9127为程序号
ps -eo pid,lstart,etime | grep 9127

服务器间的文件传输

1、服务器间传输文件
scp xxx.vcf ywf@202.198.75.117:/public/home/ywf/sll

由当前服务器传输到主机名为202.198.75.117，用户名为ywf的文件夹/public/home/ywf/sll下

2、传文件夹
scp -r /home/xxx/starmap.bam ysq@202.198.75.117:/public/home/xxxx