美文网首页
2021-01-26基因ID+TMP

2021-01-26基因ID+TMP

作者: 小森的生统笔记 | 来源:发表于2021-01-26 17:14 被阅读0次

基因ID

总参考-医学生物信息学数据库

常用:基因名称

例如: TP53, RNF180。这样的名字,是这个基因功能+编号的简写。例如TP53就是Tumor Protein P53的简写,RNF180是Ring Finger Protein 180的简写

ID号

1.最常见的就是Entrez Gene
2.在gene数据库里面对于转录本和蛋白的编号是以NM和NP开头的
3.非编码的RNA(ncRNA)的话,转录本的注释就从之前的NM开头变成了NR开头

  1. Ensembl是另外一个记录基因信息的数据库
    ensemble ID
    参考:关于基因ID的二三事

TMB

背景

免疫检查点抑制剂ICI,由于不是在所有患者中都能发挥疗效,因此需要找到对ICI治疗有良好反应的生物标志物。目前临床上使用的包括PD-L1免疫组化以及微卫星高不稳定性(microsatellite instability–high, MSI-H)或错配修复缺陷(mismatch repair deficiency, dMMR)TMB是新兴的免疫检查标志物。

由于许多使用该生物标记物的原始研究都是基于外显子测序计算的,因此通常将其视为基因组(外显子组)编码区内存在的突变数
TMB通常被报道为存在于1Mb中的突变数(计算公式即:突变个数/检测的外显子Mb长度)

参考肿瘤突变负荷TMB是个什么东东

相关文章

  • 2021-01-26基因ID+TMP

    基因ID 总参考-医学生物信息学数据库[https://www.zhihu.com/column/c_125381...

  • 2021-01-26

    2021-01-26

  • 好可怕,我有一种做不了小事的病

    Here’s How to Overcome "Errand Paralysis" 2021-01-26 379词...

  • 转载

    您好,申请转载授权 文章来源: 积木育儿 文章日期: 2021-01-26 文章标题:《我花了9年,终于亲手毁掉了...

  • 2021-01-26 行动力不断澄清

    【2021-01-26日精进 第252天/1825】表现:9分 任何靠得住的判断标准,只有行为本身。 精力去向。...

  • 2021-01-26

    2021-01-26 【周检视】0118-0124/2021月第3周周检视 健康&身体 1、来太原的第二周。 2、...

  • 2021最新强国挑战答题题库及答案大全(完整版)

    2021-01-26 (一) 1、(董其昌)是明代著名书画家,松江华亭人,“华亭画派”杰出代表,兼有“颜骨赵姿”...

  • 感恩当下

    2021-01-26(农历腊月十四)日精进第8天 |没有记录就没有发生 2021年的事业梦想个人目标描述:达成MD...

  • 非生即死

    我怎么如此幸运-重生150-戴红霞(2021-01-26) 我怎么如此幸运-非生即死 1.意想不到啾啾说全球气温变...

  • Day14 《人间失格》

    2021-01-26 今日读书,我在想我要通过读书输出什么? 其实在看叶藏的故事的时候 只有对他惋惜,自己明明不想...

网友评论

      本文标题:2021-01-26基因ID+TMP

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/fyagzktx.html