相对而言，上传普通的原始数据到NCBI，绝对是简单快捷。代谢组的数据需要上传到https://www.ebi.ac.uk/metabolights/，真的是非常困难。
- 先注册账户Create a new account (ebi.ac.uk)，填写信息。
- 然后准备你需要上传到的代谢组的原始数据和表格，
这里是BMK公司测序的非靶向代谢组测序，
原始数据分为 negative（阴性代谢物） 和positive （阳性代谢物）
此处的原始数据格式是*.raw的文件夹格式，里面的内容格式如下
image.png
BK068-ZX34-5251-neg-QC-1.raw #阳性代谢物的QC原始文件
BK068-ZX34-5251-pos-QC-1.raw #阴性代谢物的QC原始文件
BMK123456-BK123-neg-123456-01.raw #测序的阴性代谢物原始文件
BMK123456-BK123-pos-123456-01.raw #测序的阳性代谢物原始文件
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提交注意事项
从前到后，每一步填写
image.png
填写样本信息时，如果你的样本很多，则可以点击下载按钮，下载模板文件。然后在本地填写，填写完成后，在使用aspera的ascp命令把文件上传到FTP服务器。
填写样本信息
注意这里，我的是分为pos和neg,所以需要建立2个assays.
image.png
- 上传文件的注意事项
上传文件前，一定要确保文件名和系统上的文件名完全一样，不要自定义文件名或格式，否则EBI的系统识别不到你上传的文件或无法解析。
从样本名Samples，Assays（检测方法），到Metabolites(代谢物的表达量的矩阵信息)每个文件的文件名都必须和系统上的完全一致。
特别注意：Assays填写的时候，这个Raw Spectrial Data File，前面必须是FILES/原始raw文件名
image.png
这个是你上传到系统的FTP的文件目录
上传之后，需要点击这里的检查更新按钮
FTP文件上传之后，需要点击上面的check Updates按钮，然后根据提示，点击下面的Start Synchronisation进行同步解析，这样系统才能识别到你上传的文件。这个系统真的难用，相比而言NCBI的submit系统好用的多。
核验未通过的状态
所有的文件都上传完成之后，点击这里的蓝色按钮start validation按钮进行解析。
上传完成核验通过后的状态栏
核验通过后，Validation按钮后面应该是 Success颜色应该是绿色的.
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