R语言初级10题

说实话，这最简单的10道题我已经做了3遍了，每一遍都有新的体会。这一次我会把详细的记录下来，以供以后参考。

1.打开R-studio 告诉我他的工作目录
getwd()

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2.新建6个向量，基于不同的原子类型。（重点是字符串，数值，逻辑值）

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3.告诉我在你打开的rstudio里面 getwd() 代码运行后返回的是什么？
此次打开的Rproject的工作目录

4.新建一些数据结构，比如矩阵，数组，数据框，列表等重点是数据框，矩阵）

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数据太大 矩阵太小 警告了一次！！

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这个数据框建立了很久，原因是因为有一个“，”没有打出来，尴尬 一定要仔细仔细。

5.在你新建的数据框进行切片操作，比如首先取第1，3行， 然后取第4，6列

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要建立向量后才可以取到

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数据框建立小了，没有4，6列

6.使用data函数来加载R内置数据集 rivers 描述它。并且可以查看更多的R语言内置的数据集：https://mp.weixin.qq.com/s/dZPbCXccTzuj0KkOL7R31g

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7.下载 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRP133642 里面的 RunInfo Table 文件读入到R里面，了解这个数据框，多少列，每一列都是什么属性的元素。

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str函数

structure，紧凑地显示对象内部结构，即对象里有什么。

8.下载 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE111229 里面的样本信息sample.csv读入到R里面，了解这个数据框，多少列，每一列都是什么属性的元素。

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里面的seq=\t,导致表格没有了间隙，读不出列了，下面删除了

9.把前面两个步骤的两个表（RunInfo Table 文件，样本信息sample.csv）关联起来，使用merge函数。

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合不出来 难受。 分组合并错误，应该选择Accession组

10.基于下午的统计可视化

对前面读取的 RunInfo Table 文件在R里面探索其MBases列，包括 箱线图(boxplot)和五分位数(fivenum)，还有频数图(hist)，以及密度图(density) 。

把前面读取的样本信息表格的样本名字根据下划线分割看第3列元素的统计情况。第三列代表该样本所在的plate

根据plate把关联到的 RunInfo Table 信息的MBases列分组检验是否有统计学显著的差异。

分组绘制箱线图(boxplot)，频数图(hist)，以及密度图(density) 。

使用ggplot2把上面的图进行重新绘制。

使用ggpubr把上面的图进行重新绘制。

随机取384个MBases信息，跟前面的两个plate的信息组合成新的数据框，第一列是分组，第二列是MBases，总共是384*3行数据。

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了解了apply函数循环，画图上课讲太快了 没跟上