要点
![] Snipaste_2019-05-08_20-45-48.jpg安装的主要语言##(主要内容来自生信星球)
-bzip2
1.首先输入bzip2,检查有没有这个软件
2.没有,就输入yum install -y bzip2 安装
-miniconda
1.登陆服务器,进入biosoft目录--cd biosoft
2.--wget + 刚才你复制的下载链接
3.--bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh(意思是用bash运行这个安装用的脚本,脚本就是你刚才下载的东西。)
4.一路Enter,看到第5个“Yes”OR“NO”输入yes
5.敲回车
6.等待安装结束后输入yes
--激活
1.source ~/.bashrc(命令行输入conda,出现满屏的信息说明成功了,出现一行简短的报错说明挂了。)
2.添加镜像—
把下面的代码一行一行复制到命令行,粘贴、回车
(“#”新手安装不需要remove 所以加了井号。如果曾经添加过国内镜像,需要去掉下一行行首的#再运行第一行。)
“# conda config --remove-key channels
conda config --add channels r
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --set show_channel_urls yes”
--开始使用conda
- 查看当前所有软件列表 conda list
- 搜索软件 conda search fastqc
- 安装软件 conda install fastqc -y 【加上-y是自动安装,你可以试试不加-y有什么区别】
- 卸载软件 conda remove fastqc -y
心得
还挺好玩的,希望结识一些生信大佬
网友评论