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学习小组Day3笔记--朝宇

学习小组Day3笔记--朝宇

作者: 兰草蓝梦 | 来源:发表于2019-05-08 21:10 被阅读1次

    要点

    ![] Snipaste_2019-05-08_20-45-48.jpg

    安装的主要语言##(主要内容来自生信星球)

    -bzip2
    1.首先输入bzip2,检查有没有这个软件
    2.没有,就输入yum install -y bzip2 安装
    -miniconda
    1.登陆服务器,进入biosoft目录--cd biosoft
    2.--wget + 刚才你复制的下载链接
    3.--bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh(意思是用bash运行这个安装用的脚本,脚本就是你刚才下载的东西。)
    4.一路Enter,看到第5个“Yes”OR“NO”输入yes
    5.敲回车
    6.等待安装结束后输入yes
    --激活
    1.source ~/.bashrc(命令行输入conda,出现满屏的信息说明成功了,出现一行简短的报错说明挂了。)
    2.添加镜像—
    把下面的代码一行一行复制到命令行,粘贴、回车
    (“#”新手安装不需要remove 所以加了井号。如果曾经添加过国内镜像,需要去掉下一行行首的#再运行第一行。)

    “# conda config --remove-key channels
    conda config --add channels r
    conda config --add channels conda-forge
    conda config --add channels bioconda
    conda config --set show_channel_urls yes”

    --开始使用conda

    1. 查看当前所有软件列表 conda list
    2. 搜索软件 conda search fastqc
    3. 安装软件 conda install fastqc -y 【加上-y是自动安装,你可以试试不加-y有什么区别】
    4. 卸载软件 conda remove fastqc -y

    心得

    还挺好玩的,希望结识一些生信大佬

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