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有趣 | 生物狗 如何 不直接地 表达想法

有趣 | 生物狗 如何 不直接地 表达想法

作者: 生信石头 | 来源:发表于2020-09-09 08:22 被阅读0次

    写在前面

    前面七夕节给大家整了一个“单身狗”游戏插件。我个人觉得还是挺好完的。其实只要是什么相聚或者团圆的节日,单身狗游戏插件都是送礼佳品。
    很快就教师节。我们必须严肃一点,要搞事情也搞点跟学习相关(擦边)的事情。
    突发奇想,写了一个有趣的功能。

    Funny Codon

    节日祝福的书写是一个让人困扰的事情,写的普通,显得没诚意;写得肉麻,不小心被认为是网上抄的。咋办?
    我们都非常清楚,对于编码基因,DNA 转录产生 mRNA,基于 mRNA 上的密码子(三个为一组的碱基)翻译形成蛋白。于是,这中间就涉及到,三个碱基对应一个氨基酸。常见的氨基酸有 20 种,使用了 20 个英文字母表示。也就是说,除了 6 个英文字母外,所有的英文字母都对应了一种常见氨基酸,也就对应了一堆密码子。于是这就解决了一个问题。
    教师节对吧?Happy Teacher's Day嘛。


    不要直接写句子,先换成密码子再写上去,“心意也有了,关键是长度也有了”。(字数越多越好嘛,跟写论文类似的)。

    保证不重样

    那么问题来了,一个实验室有很多学生啊,不可能每个人都写得一样吧?完全可以放心。结果输出是随机的,不同氨基酸密码子的简并程度不同,乘起来绝对够数。我给大伙生成几个不重样的。

    1: CAU GCC CCU CCU UAC ACU GAA GCG UGC CAU GAA CGU UCA GAC GCC UAU
    2: CAU GCG CCU CCU UAU ACA GAA GCU UGU CAU GAG CGC AGU GAU GCU UAC
    3: CAU GCA CCU CCU UAC ACU GAA GCC UGC CAC GAA AGA UCC GAU GCC UAU
    ....

    还有很多,不过他们都是同一句话,Happy Teacher's Day。

    有更复杂的句子咋整?

    不用太担心,这个我肯定考虑到了。做过 5-race 实验的,都知道次黄嘌呤吧?既然 ATCG 四种碱基都用了,我们再加一种上去,自己补充一个密码子映射到不能存在的氨基酸字符就好了。比如:



    直接拿 TBtools 的每日鸡汤翻成密码子,多好啊。
    也或许你要表白吧?


    收到密文祝福,咋整?

    有发送的,就有接收的。大伙把这个密文祝福发送出去的时候,别忘了一件重要的事情:顺便发送一个 TBtools。
    因为,只要有了 TBtools,接收的人又可以快速翻译得到正文。比如:



    当然,可能缺点还是在于,空格和标点符号咋整....

    写在最后

    Emmm,从突发奇想到工具输出,花了大半个钟头。老了,不过还是有趣,
    预祝各位老师,CAU GCC CCU CCU UAC ACU GAA GCG UGC CAU GAA CGU UCA GAC GCC UAU
    预祝各位学生,UCU GIG UGU UGC GAG AGU UCG UUU GIU UUG GGC CGC GCG GAC GIU GCC ACU AUA CIG AAU
    Tips: AIN->B TIN->J CIN->O GIN->U IAN->X ICN->Z

    写在最后

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