2022-04-02 Picard遇到的java（JDK）问题

1.今天简历基因组索引

picard CreateSequenceDictionary R=LH9.fasta &> picardindex.log &

picard报错：

Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: picard/cmdline/PicardCommandLine : Unsupported major.minor version 52.0

        at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)

        at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800)

        at java.security.SecureClassLoader.defineClass(SecureClassLoader.java:142)

        at java.net.URLClassLoader.defineClass(URLClassLoader.java:449)

        at java.net.URLClassLoader.access$100(URLClassLoader.java:71)

        at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:361)

        at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355)

        at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)

        at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)

        at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)

        at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308)

        at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)

        at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:482)

网络搜索原因是

picard-2.18.29-0 需要的是java 1.8环境

而系统

java -version

javac -version 均为1.7

2.JDK各个版本发布时间和版本名称表

https://blog.csdn.net/wq6ylg08/article/details/91351603

基本锁定错误，JDK（Java）版本过低导致

3. 利用conda单独为picard创建一个java 1.8环境

conda create -n java8 java-jdk=8.0.92

conda activate java8

conda install picard

重新运行认为完美解决。